RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 TUBD1Q9UJT1 453 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 A0A1W2PPE2 198 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 CA11O75493 328 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 EDN3P14138 238 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 NQO2P16083 231 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 IL13RA2Q14627 380 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 SSC4DQ8WTU2 575 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 IL36RNQ9UBH0 155 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 CACFD1Q9UGQ2 172 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 C3orf80F5H4A9 247 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 IFNA5P01569 189 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 SEC11BP0C7V7 166 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 RAB1AP62820 205 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 SRPXP78539 464 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 ESPL1Q14674 2120 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 LYL1P12980 280 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 MOB3AQ96BX8 217 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 COL4A2P08572 1712 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 CD5P06127 495 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 TCEAL3Q969E4 200 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 IFNA4P05014 189 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 RUNX1Q01196 453 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 STX12Q86Y82 276 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 C17orf78Q8N4C9 275 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 SCGB1C1Q8TD33 95 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 RARRES2Q99969 163 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 HES7Q9BYE0 225 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 MMP24Q9Y5R2 645 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 SNCAP37840 140 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 UBE2KP61086 200 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 SLC35B3Q9H1N7 401 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 APLNRP35414 380 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 IL15RAQ13261 267 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 TMEM211Q6ICI0 200 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 CRIP3Q6Q6R5 217 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 APH1AQ96BI3 265 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 ZNF724A8MTY0 619 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 HEXAP06865 529 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 DANCRP0C864 163 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 ATP6V0CP27449 155 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 TMEM164Q5U3C3 297 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 CT55Q8WUE5 264 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 CLDN23Q96B33 292 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 STRADBQ9C0K7 418 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 ZNF391Q9UJN7 358 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 C5orf52A6NGY3 159 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 H7C1Q1 480 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 OR2C1O95371 312 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 IL22RA1Q8N6P7 574 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 DEPPQ9NTK1 212 aa15.9■□□□□ 0.14
LRP3-201ENST00000253193 FREM1Q5H8C1 2179 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 FAM157AC9JC47 383 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 DKK1O94907 266 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 NGFP01138 241 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 CELA3AP09093 270 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 KIR2DS4P43632 304 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 KIR2DS1Q14954 304 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 OR10J5Q8NHC4 309 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 GALNT14Q96FL9 552 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 POMT1Q9Y6A1 747 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 ZNF716A6NP11 495 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 CHST1O43916 411 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 IGHEP01854 428 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 DYNLT3P51808 116 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 HIST1H3AP68431 136 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 NCMAPQ5T1S8 102 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 HIST2H3AQ71DI3 136 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 MIOXQ9UGB7 285 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 FRYLO94915 3013 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 IGLV3-1P01715 115 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 IAPPP10997 89 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 RAB5CP51148 216 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 ZNF154Q13106 437 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 OR1J1Q8NGS3 322 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.89■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 YKT6O15498 198 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 COL19A1Q14993 1142 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms