RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAF4-216ENST00000586813 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
TRAF4-216ENST00000586813 ALDH1L1O75891 902 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAF4-216ENST00000586813 PRKG1Q13976 671 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAF4-216ENST00000586813 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAF4-216ENST00000586813 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAF4-216ENST00000586813 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAF4-216ENST00000586813 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 F8W031 263 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 PLIN1O60240 522 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 TM4SF4P48230 202 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 CFAP100Q494V2 611 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 JAG2Q9Y219 1238 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 MYO1BO43795 1136 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 TBC1D8O95759 1140 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 SPDYE6P0CI01 402 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 SREBF2Q12772 1141 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF521Q96K83 1311 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 FZD1Q9UP38 647 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 KAZALD1Q96I82 304 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 SUCLG2Q96I99 432 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 OTOFQ9HC10 1997 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 CLRN2A0PK11 232 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 SPRYD7Q5W111 196 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TRAF4-216ENST00000586813 UTYO14607 1347 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 AOX1Q06278 1338 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 MAP3K11Q16584 847 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 SOX10P56693 466 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 UBE4AQ14139 1066 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 VEZTQ9HBM0 779 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 GPR25O00155 361 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 GYG1P46976 350 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.58e-14■■■■□ 26.3
TRAF4-216ENST00000586813 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.39■■□□□ 1.5
TRAF4-216ENST00000586813 UNCXA6NJT0 531 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 RASA3Q14644 834 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 WNK4Q96J92 1243 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 PTPRCP08575 1304 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 ALDH1A1P00352 501 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 FKTNO75072 461 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 INHBEP58166 350 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 TNFAIP1Q13829 316 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 LRRC24Q50LG9 513 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 IFNL1Q8IU54 200 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 E9PSI1 815 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 METTL24Q5JXM2 366 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 VPS37DQ86XT2 251 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 CRKP46108 304 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TRAF4-216ENST00000586813 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.5 ms