RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550274.1

LETMD1-222, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LETMD1, Length 809 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-222ENST00000550274 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa16.05■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 VAMP4O75379 141 aa16.05■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 FOXO4P98177 505 aa16.05■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.05■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 F6X3S4 739 aa16.04■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 LDLRAD1Q5T700 205 aa16.04■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.04■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa16.04■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 AOX1Q06278 1338 aa16.03■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 GPR25O00155 361 aa16.03■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.03■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.03■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 IL1R1P14778 569 aa16.02■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 SREBF2Q12772 1141 aa16.02■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 DLGAP5Q15398 846 aa16.02■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 BEND3Q5T5X7 828 aa16.02■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 SPRYD7Q5W111 196 aa16.02■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.02■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 JAG2Q9Y219 1238 aa16.02■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.02■□□□□ 0.16
LETMD1-222ENST00000550274 F8W031 263 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 CFHR5Q9BXR6 569 aa16.01■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 MRS2Q9HD23 443 aa16.01■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 MYH13Q9UKX3 1938 aa16■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 CLRN2A0PK11 232 aa16■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 CFAP100Q494V2 611 aa16■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 LMBR1LQ6UX01 489 aa16■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 WDR63Q8IWG1 891 aa16■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 CLMNQ96JQ2 1002 aa16■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 BRCA2P51587 3418 aa15.99■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.99■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 SPDYE6P0CI01 402 aa15.99■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 MAP3K11Q16584 847 aa15.99■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 GRM8O00222 908 aa15.98■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 PLIN1O60240 522 aa15.98■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 FKTNO75072 461 aa15.98■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 WNK4Q96J92 1243 aa15.98■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 VEZTQ9HBM0 779 aa15.98■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa15.98■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.97■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.97■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 IFNL1Q8IU54 200 aa15.97■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.97■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 MYO1BO43795 1136 aa15.96■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.96■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.96■□□□□ 0.15
LETMD1-222ENST00000550274 FAM205AQ6ZU69 1335 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 ALDH1A1P00352 501 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 GJA5P36382 358 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 RASA3Q14644 834 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 USP2O75604 605 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 GYG1P46976 350 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 INHBEP58166 350 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 KAZALD1Q96I82 304 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 SUCLG2Q96I99 432 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 ALDH1L1O75891 902 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 SLC4A10Q6U841 1118 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 TRIM17Q9Y577 477 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 UNCXA6NJT0 531 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 UBE4AQ14139 1066 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-222ENST00000550274 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms