RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.6■■□□□ 1.37
LTBR-211ENST00000543190 SNAP23O00161 211 aa23.59■■□□□ 1.37
LTBR-211ENST00000543190 TM4SF4P48230 202 aa23.59■■□□□ 1.37
LTBR-211ENST00000543190 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.59■■□□□ 1.37
LTBR-211ENST00000543190 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
LTBR-211ENST00000543190 E9PSI1 815 aa23.57■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 TRPA1O75762 1119 aa23.57■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 DLGAP5Q15398 846 aa23.57■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 FBXW7Q969H0 707 aa23.57■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.57■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.56■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.56■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 SPDYE6P0CI01 402 aa23.56■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.56■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.56■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.56■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.55■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 DGKZQ13574 1117 aa23.55■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 MOB2Q70IA6 237 aa23.55■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.55■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.55■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.54■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.54■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 SUCLG2Q96I99 432 aa23.54■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 MYO1BO43795 1136 aa23.53■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.53■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.52■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.52■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 SREBF2Q12772 1141 aa23.52■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.52■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.52■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 KIF16BQ96L93 1317 aa23.52■■□□□ 1.36
LTBR-211ENST00000543190 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 INHBEP58166 350 aa23.51■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 SLFN5Q08AF3 891 aa23.51■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.51■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.51■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 CFAP100Q494V2 611 aa23.5■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.5■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 USP44Q9H0E7 712 aa23.5■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 SPRYD7Q5W111 196 aa23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 MRIQ9BWK5 157 aa23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 OTOFQ9HC10 1997 aa23.49■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 TNFAIP1Q13829 316 aa23.48■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.48■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 PDE8BO95263 885 aa23.47■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 ALDH1A1P00352 501 aa23.47■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.47■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB22O15209 634 aa23.46■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 PLIN1O60240 522 aa23.46■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 GYG1P46976 350 aa23.46■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.46■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.46■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.46■■□□□ 1.35
LTBR-211ENST00000543190 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 FBXO3Q9UK99 471 aa23.44■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 AOX1Q06278 1338 aa23.43■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 GPR25O00155 361 aa23.43■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 FGFR2P21802 821 aa23.43■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 RASA3Q14644 834 aa23.43■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.43■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 F8W031 263 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 LRRC24Q50LG9 513 aa23.42■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.42■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 HTTP42858 3142 aa23.42■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 CLRN2A0PK11 232 aa23.41■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.41■■□□□ 1.34
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.41■■□□□ 1.34
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