RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513420.1

CTBP1-212, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 3

Gene CTBP1, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-212	ENST00000513420	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		18.55	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	SUCLG2	Q96I99	432 aa		18.55	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	CSRNP1	Q96S65	589 aa		18.55	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	IL1R1	P14778	569 aa		18.54	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	JAG2	Q9Y219	1238 aa		18.54	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		18.53	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	PTPRC	P08575	1304 aa		18.53	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	PRKG1	Q13976	671 aa		18.53	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	CERS5	Q8N5B7	392 aa		18.53	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	18.52	■□□□□ 0.56	6e-7	■■■□□ 16.1
CTBP1-212	ENST00000513420	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	UBE4A	Q14139	1066 aa		18.52	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	CFAP100	Q494V2	611 aa		18.52	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
CTBP1-212	ENST00000513420	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.51	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		18.51	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		18.51	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	VEZT	Q9HBM0	779 aa		18.51	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		18.51	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		18.5	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	GYG1	P46976	350 aa		18.5	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	UTY	O14607	1347 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	CLRN2	A0PK11	232 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	SREBF2	Q12772	1141 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	METTL24	Q5JXM2	366 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	KAZALD1	Q96I82	304 aa		18.49	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		18.48	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	SPDYE6	P0CI01	402 aa		18.48	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		18.48	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		18.48	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	SLFN5	Q08AF3	891 aa		18.47	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		18.47	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		18.47	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		18.47	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.46	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		18.46	■□□□□ 0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	TBC1D8	O95759	1140 aa		18.45	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	TNFAIP1	Q13829	316 aa		18.45	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		18.45	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		18.45	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	FZD1	Q9UP38	647 aa		18.45	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	TM4SF4	P48230	202 aa		18.44	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	LRRC24	Q50LG9	513 aa		18.44	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		18.44	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		18.44	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		18.44	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	PDE8B	O95263	885 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	SPRYD7	Q5W111	196 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		18.43	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	RASA3	Q14644	834 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	MAP3K11	Q16584	847 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	USP44	Q9H0E7	712 aa		18.42	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ALDH1A1	P00352	501 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	CRK	P46108	304 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	TNNI2	P48788	182 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	AOX1	Q06278	1338 aa		18.41	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	UNCX	A6NJT0	531 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	WNK4	Q96J92	1243 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		18.4	■□□□□ 0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		18.39	■□□□□ 0.53
CTBP1-212	ENST00000513420	GPR25	O00155	361 aa		18.39	■□□□□ 0.53

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