RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510780.5

RASGEF1B-208, Transcript of RasGEF domain family member 1B, human

TSL 3 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 539 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MMP14	P50281	582 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RASGEF1B-208	ENST00000510780	AOX1	Q06278	1338 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RASGEF1B-208	ENST00000510780	IL1R1	P14778	569 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASGEF1B-208	ENST00000510780	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASGEF1B-208	ENST00000510780	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SOX10	P56693	466 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CLRN2	A0PK11	232 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TM4SF4	P48230	202 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CFAP100	Q494V2	611 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SUCLG2	Q96I99	432 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ALDH1L1	O75891	902 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	KAZALD1	Q96I82	304 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	VEZT	Q9HBM0	779 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	GYG1	P46976	350 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SPRYD7	Q5W111	196 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	27.81	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	GPR25	O00155	361 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SREBF2	Q12772	1141 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MYO1B	O43795	1136 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZNF521	Q96K83	1311 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MAP3K11	Q16584	847 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RASGEF1B-208	ENST00000510780	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	OTOF	Q9HC10	1997 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RASA3	Q14644	834 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	WNK4	Q96J92	1243 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	UTY	O14607	1347 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	LAMB1	P07942	1786 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	GRIK5	Q16478	980 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	IFNL1	Q8IU54	200 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	FKTN	O75072	461 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	GJA5	P36382	358 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CRK	P46108	304 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	METTL24	Q5JXM2	366 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ALDH1A1	P00352	501 aa		27.67	■■■□□ 2.02

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