RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, human

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNF8-208	ENST00000510195	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		33.55	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	NF2	P35240	595 aa		33.54	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	CERS5	Q8N5B7	392 aa		33.54	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	DLGAP5	Q15398	846 aa		33.53	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		33.53	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	USP44	Q9H0E7	712 aa		33.52	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	TSKS	Q9UJT2	592 aa		33.52	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		33.51	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		33.51	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		33.51	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		33.48	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	MYO1B	O43795	1136 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	CSRNP1	Q96S65	589 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		33.46	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	GYG1	P46976	350 aa		33.45	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	ABHD8	Q96I13	439 aa		33.45	■■■□□ 2.95
SNF8-208	ENST00000510195	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	SPDYE6	P0CI01	402 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	CFAP100	Q494V2	611 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	METTL24	Q5JXM2	366 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195		F8W031	263 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	PDE8B	O95263	885 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	LRRC24	Q50LG9	513 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	MOB2	Q70IA6	237 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	RNF186	Q9NXI6	227 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	VPS37D	Q86XT2	251 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	JAG2	Q9Y219	1238 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	KIF16B	Q96L93	1317 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	TRPA1	O75762	1119 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
SNF8-208	ENST00000510195	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	33.38	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	MAP3K11	Q16584	847 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	UNCX	A6NJT0	531 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	FBXO3	Q9UK99	471 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	EYA2	O00167	538 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	TM4SF4	P48230	202 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	TNFAIP1	Q13829	316 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	CLRN2	A0PK11	232 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	FGFR2	P21802	821 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	VEZT	Q9HBM0	779 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SNF8-208	ENST00000510195	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	PRKG1	Q13976	671 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	MRI	Q9BWK5	157 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	SREBF2	Q12772	1141 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	LPIN2	Q92539	896 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	CRK	P46108	304 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	BCAM	P50895	628 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	DGKZ	Q13574	1117 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	RASA3	Q14644	834 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	CIAO1	O76071	339 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	SLC5A1	P13866	664 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	AOX1	Q06278	1338 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SNF8-208	ENST00000510195	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92

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