RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 DEFB115Q30KQ5 88 aa31.03■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA0825Q8IV33 1275 aa31.03■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 SULF1Q8IWU6 871 aa31.03■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 CEP126Q9P2H0 1117 aa31.03■■■□□ 2.56
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CXCL3-202ENST00000502974 PCNTO95613 3336 aa31.03■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 RASSF10A6NK89 507 aa31.02■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 FGFR2P21802 821 aa31.02■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 MMP14P50281 582 aa31.02■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 MVPQ14764 893 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 VPS37DQ86XT2 251 aa31.02■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 COG6Q9Y2V7 657 aa31.02■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
CXCL3-202ENST00000502974 ADM5C9JUS6 153 aa31.01■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 CAVIN4Q5BKX8 364 aa31.01■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 SLC5A1P13866 664 aa31■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 JAG2Q9Y219 1238 aa31■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 VEGFBP49765 207 aa30.99■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 ATP2B3Q16720 1220 aa30.99■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 FBXO33Q7Z6M2 555 aa30.99■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 LPIN2Q92539 896 aa30.99■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 TLL2Q9Y6L7 1015 aa30.99■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 SASH1O94885 1247 aa30.98■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 ATP8B2P98198 1209 aa30.98■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 BCAMP50895 628 aa30.97■■■□□ 2.55
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CXCL3-202ENST00000502974 DDX19BQ9UMR2 479 aa30.97■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.97■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 POLA2Q14181 598 aa30.96■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 NBPF9Q3BBW0 867 aa30.96■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 C20orf194Q5TEA3 1177 aa30.96■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 DLK2Q6UY11 383 aa30.96■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 PDE3AQ14432 1141 aa30.95■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 SSH3Q8TE77 659 aa30.95■■■□□ 2.55
CXCL3-202ENST00000502974 FAM205AQ6ZU69 1335 aa30.95■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 F8W031 263 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 WNT10BO00744 389 aa30.94■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 TFCP2Q12800 502 aa30.94■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 SAPCD2Q86UD0 394 aa30.94■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 MYH13Q9UKX3 1938 aa30.93■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 ECE1P42892 770 aa30.93■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 CEP85Q6P2H3 762 aa30.93■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 ARAP2Q8WZ64 1704 aa30.93■■■□□ 2.54
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CXCL3-202ENST00000502974 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 GRM1Q13255 1194 aa30.92■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 MFSD14BQ5SR56 506 aa30.92■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 CDCA5Q96FF9 252 aa30.92■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 DLGAP5Q15398 846 aa30.91■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 CAPNS2Q96L46 248 aa30.91■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 CYP4F22Q6NT55 531 aa30.9■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 C2orf69Q8N8R5 385 aa30.9■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 AKAP2Q9Y2D5 859 aa30.9■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 HHIPL1Q96JK4 782 aa30.89■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.89■■■□□ 2.54
CXCL3-202ENST00000502974 SURF6O75683 361 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 ADORA1P30542 326 aa30.88■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 TIMM10P62072 90 aa30.88■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 A0A1B0GUL7 405 aa30.87■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 HUNKP57058 714 aa30.87■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 ECM29Q5VYK3 1845 aa30.87■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 CFAP100Q494V2 611 aa30.86■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.86■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa30.86■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 MYO1BO43795 1136 aa30.85■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 PHKA1P46020 1223 aa30.85■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 NEUROD6Q96NK8 337 aa30.84■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 THSD7BQ9C0I4 1608 aa30.84■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 SPDYE2BA6NHP3 402 aa30.83■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 SPDYE6P0CI01 402 aa30.83■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 AIDAQ96BJ3 306 aa30.83■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 XAGE2Q96GT9 111 aa30.83■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.53
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC102BQ68D86 513 aa30.82■■■□□ 2.52
CXCL3-202ENST00000502974 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.82■■■□□ 2.52
CXCL3-202ENST00000502974 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CXCL3-202ENST00000502974 GRIK5Q16478 980 aa30.81■■■□□ 2.52
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