RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-210ENST00000489601 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
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SH3BP4-210ENST00000489601 TAF7LQ5H9L4 462 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP4-210ENST00000489601 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP4-210ENST00000489601 CNNM1Q9NRU3 951 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.99■□□□□ 0.95
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SH3BP4-210ENST00000489601 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
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SH3BP4-210ENST00000489601 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
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SH3BP4-210ENST00000489601 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.92■□□□□ 0.94
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SH3BP4-210ENST00000489601 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
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SH3BP4-210ENST00000489601 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
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SH3BP4-210ENST00000489601 RASA3Q14644 834 aa20.88■□□□□ 0.93
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SH3BP4-210ENST00000489601 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.88■□□□□ 0.93
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SH3BP4-210ENST00000489601 WNK4Q96J92 1243 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.87■□□□□ 0.93
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SH3BP4-210ENST00000489601 IFNL1Q8IU54 200 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 USP44Q9H0E7 712 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 PDE8BO95263 885 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 CRKP46108 304 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 SLFN5Q08AF3 891 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4-210ENST00000489601 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.84■□□□□ 0.93
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