RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485941.2

NBPF3-211, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NBPF3, Length 921 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-211ENST00000485941 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 DEFB129Q9H1M3 183 aa29.61■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 AOX1Q06278 1338 aa29.61■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.6■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 FZD1Q9UP38 647 aa29.6■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 GRM8O00222 908 aa29.59■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 SOX10P56693 466 aa29.59■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 DLGAP5Q15398 846 aa29.59■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 SPRYD7Q5W111 196 aa29.59■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa29.59■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 GPR25O00155 361 aa29.58■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 PRKG1Q13976 671 aa29.58■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 HPS5Q9UPZ3 1129 aa29.58■■■□□ 2.33
NBPF3-211ENST00000485941 SPDYE2BA6NHP3 402 aa29.57■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 SPDYE6P0CI01 402 aa29.57■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 KAZALD1Q96I82 304 aa29.57■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF804AQ7Z570 1209 aa29.56■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.56■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 ECM29Q5VYK3 1845 aa29.56■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.55■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 SREBF2Q12772 1141 aa29.55■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 CFAP100Q494V2 611 aa29.55■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.55■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.55■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 ALDH1L1O75891 902 aa29.54■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 LAMB1P07942 1786 aa29.54■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa29.53■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.53■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 F8W031 263 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 CLMNQ96JQ2 1002 aa29.52■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 JAG2Q9Y219 1238 aa29.52■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 HTTP42858 3142 aa29.52■■■□□ 2.32
NBPF3-211ENST00000485941 CLRN2A0PK11 232 aa29.51■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 UNCXA6NJT0 531 aa29.51■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 UTYO14607 1347 aa29.5■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF521Q96K83 1311 aa29.5■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 ANP32CO43423 234 aa29.5■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 UBE4AQ14139 1066 aa29.5■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 SUCLG2Q96I99 432 aa29.5■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 PLIN1O60240 522 aa29.49■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.49■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 WNK4Q96J92 1243 aa29.49■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 CNNM1Q9NRU3 951 aa29.49■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa29.49■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 INHBEP58166 350 aa29.48■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 IFNL1Q8IU54 200 aa29.48■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.48■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 FKTNO75072 461 aa29.47■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 GJA5P36382 358 aa29.47■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 MYO1BO43795 1136 aa29.46■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 ALDH1A1P00352 501 aa29.46■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 GYG1P46976 350 aa29.46■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 RASA3Q14644 834 aa29.46■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa29.46■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.45■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.45■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 SERPINA10Q9UK55 444 aa29.45■■■□□ 2.31
NBPF3-211ENST00000485941 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.44■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.44■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 TEPSINQ96N21 525 aa29.44■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 VEZTQ9HBM0 779 aa29.44■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 FBXO33Q7Z6M2 555 aa29.43■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 GRIK5Q16478 980 aa29.42■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.42■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 CDAN1Q8IWY9 1227 aa29.41■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.41■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.41■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 PTPN18Q99952 460 aa29.41■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.39■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.39■■■□□ 2.3
NBPF3-211ENST00000485941 MROH5Q6ZUA9 1318 aa29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms