RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482519.1

VAMP4-204, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene VAMP4, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-204ENST00000482519 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 PCNTO95613 3336 aa20.63■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 RASSF10A6NK89 507 aa20.63■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 SRGAP3O43295 1099 aa20.63■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 GNAI2P04899 355 aa20.63■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.63■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 WNT10BO00744 389 aa20.61■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 CIAO1O76071 339 aa20.61■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 SLC5A1P13866 664 aa20.61■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 BCAMP50895 628 aa20.61■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.61■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.61■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.61■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.61■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 MMP14P50281 582 aa20.6■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.6■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.59■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 RLBP1P12271 317 aa20.59■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 DLGAP5Q15398 846 aa20.59■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.59■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.59■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 LPIN2Q92539 896 aa20.59■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 CDCA5Q96FF9 252 aa20.59■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 COPRSQ9NQ92 184 aa20.59■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 FBXO3Q9UK99 471 aa20.59■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 FGFR2P21802 821 aa20.58■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 ATP2B3Q16720 1220 aa20.58■□□□□ 0.89
VAMP4-204ENST00000482519 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.57■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.57■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.57■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 CAPNS2Q96L46 248 aa20.57■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.57■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 ECE1P42892 770 aa20.56■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 HUNKP57058 714 aa20.56■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 MTX1Q13505 466 aa20.56■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 CFAP100Q494V2 611 aa20.56■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 PANK1Q8TE04 598 aa20.56■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.56■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.55■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 MYO1BO43795 1136 aa20.54■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.54■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 CLRN2A0PK11 232 aa20.53■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 TFCP2Q12800 502 aa20.53■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.53■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.52■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 AOC2O75106 756 aa20.52■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 SPDYE6P0CI01 402 aa20.52■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 ADORA1P30542 326 aa20.52■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 TIMM10P62072 90 aa20.52■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 GRIK5Q16478 980 aa20.52■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.52■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 AIDAQ96BJ3 306 aa20.52■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 VEZTQ9HBM0 779 aa20.52■□□□□ 0.88
VAMP4-204ENST00000482519 MS4A1P11836 297 aa20.51■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.51■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.51■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.51■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 CRKP46108 304 aa20.5■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.5■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.5■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 AOX1Q06278 1338 aa20.5■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.5■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 A0A1B0GUL7 405 aa20.49■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 NF2P35240 595 aa20.49■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 PHKA1P46020 1223 aa20.49■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 ATP8B2P98198 1209 aa20.49■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 RGMBQ6NW40 437 aa20.49■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 MOB2Q70IA6 237 aa20.49■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.49■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 PRKG1Q13976 671 aa20.48■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.48■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.48■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.47■□□□□ 0.87
VAMP4-204ENST00000482519 GORABQ5T7V8 394 aa20.47■□□□□ 0.87
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