RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 COG6Q9Y2V7 657 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 SEMA3EO15041 775 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 CEP85Q6P2H3 762 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 EGFRP00533 1210 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 MXD3Q9BW11 206 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 GPR108Q9NPR9 543 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 BCAMP50895 628 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 CERS5Q8N5B7 392 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 HMMRO75330 724 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 SCARF1Q14162 830 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-203ENST00000474160 A0A1B0GUL7 405 aa23.39■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 TFCP2Q12800 502 aa23.39■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.39■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.39■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 SULF1Q8IWU6 871 aa23.39■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 GGA3Q9NZ52 723 aa23.39■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.39■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 WNT10BO00744 389 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 MAST3O60307 1309 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 CEP350Q5VT06 3117 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 DLGAP5Q15398 846 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 KLRG1Q96E93 195 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 MRIQ9BWK5 157 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 MYO1BO43795 1136 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 CCDC102BQ68D86 513 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 USP48Q86UV5 1035 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 XAGE2Q96GT9 111 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 TRAF5O00463 557 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 TIMM10P62072 90 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 JAG2Q9Y219 1238 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 SPDYE6P0CI01 402 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 PHKA1P46020 1223 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 CFAP100Q494V2 611 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-203ENST00000474160 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 RASSF10A6NK89 507 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 F8W031 263 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 TNNI3KQ59H18 835 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 GORABQ5T7V8 394 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 CST9Q5W186 159 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 CNTNAP1P78357 1384 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 ADORA1P30542 326 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 HTRA3P83110 453 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 TEKT1Q969V4 418 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 ADM5C9JUS6 153 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 IGSF3O75054 1194 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 RAB11FIP3O75154 756 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 CRKP46108 304 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 FKBP1BP68106 108 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-203ENST00000474160 JMYQ8N9B5 988 aa23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms