RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468845.1

CREB3L4-209, Transcript of cAMP responsive element binding protein 3 like 4, human

TSL 3

Gene CREB3L4, Length 906 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREB3L4-209	ENST00000468845	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	KCNJ4	P48050	445 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	PLIN1	O60240	522 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	PRKG1	Q13976	671 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	GRIK5	Q16478	980 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	GYG1	P46976	350 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CREB3L4-209	ENST00000468845	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	TM4SF4	P48230	202 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	MMP14	P50281	582 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	TBC1D8	O95759	1140 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	GJA5	P36382	358 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	NF2	P35240	595 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	PTPRC	P08575	1304 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	HTT	P42858	3142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845		E9PSI1	815 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	GPR25	O00155	361 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	FGFR2	P21802	821 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	SOX10	P56693	466 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	CAP1	Q01518	475 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	RASA3	Q14644	834 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CREB3L4-209	ENST00000468845	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CREB3L4-209	ENST00000468845	PDE8B	O95263	885 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CREB3L4-209	ENST00000468845	CRK	P46108	304 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CREB3L4-209	ENST00000468845	BCAM	P50895	628 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CREB3L4-209	ENST00000468845	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
CREB3L4-209	ENST00000468845	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CREB3L4-209	ENST00000468845	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CREB3L4-209	ENST00000468845	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
CREB3L4-209	ENST00000468845	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CREB3L4-209	ENST00000468845	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms