RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460132.5

PLOD3-208, Transcript of procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, human

TSL 3

Gene PLOD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLOD3-208	ENST00000460132	EYA2	O00167	538 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	CDCA5	Q96FF9	252 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	WBP1L	Q9NX94	342 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132		F8W031	263 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	HUNK	P57058	714 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	FOXN1	O15353	648 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	AOC2	O75106	756 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	GNAI3	P08754	354 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	SIL1	Q9H173	461 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	FGFR2	P21802	821 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	BCAM	P50895	628 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	DLGAP5	Q15398	846 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	AIDA	Q96BJ3	306 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	CIAO1	O76071	339 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	MAP2K2	P36507	400 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	FBXO3	Q9UK99	471 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	CFAP100	Q494V2	611 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	RGMB	Q6NW40	437 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	COPRS	Q9NQ92	184 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	IFFO2	Q5TF58	517 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	LPIN2	Q92539	896 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PLOD3-208	ENST00000460132	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	SRGAP3	O43295	1099 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	SPDYE6	P0CI01	402 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	SLC5A1	P13866	664 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	GRIK5	Q16478	980 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	MOB2	Q70IA6	237 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	ZIC5	Q96T25	663 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	AOX1	Q06278	1338 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	GNAI2	P04899	355 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	FKBP1B	P68106	108 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	NOG	Q13253	232 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	MTX1	Q13505	466 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	CCDC102A	Q96A19	550 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	CLRN2	A0PK11	232 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	MYO1B	O43795	1136 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	LBX1	P52954	281 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	ATP2B3	Q16720	1220 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	RLBP1	P12271	317 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	NF2	P35240	595 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	VEZT	Q9HBM0	779 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	SLC10A3	P09131	477 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	CRK	P46108	304 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	PRKG1	Q13976	671 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	TNS4	Q8IZW8	715 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PLOD3-208	ENST00000460132	TIMM10	P62072	90 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PLOD3-208	ENST00000460132	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
PLOD3-208	ENST00000460132	TFCP2	Q12800	502 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PLOD3-208	ENST00000460132	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
PLOD3-208	ENST00000460132	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
PLOD3-208	ENST00000460132	TSKS	Q9UJT2	592 aa		18.14	■□□□□ 0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms