RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 F8W031 263 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ECE1P42892 770 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HUNKP57058 714 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 METTL24Q5JXM2 366 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIF16BQ96L93 1317 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HHIPL1Q96JK4 782 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MOB2Q70IA6 237 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OGFOD1Q8N543 542 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRIM27P14373 513 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GRIK5Q16478 980 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATG9AQ7Z3C6 839 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FBXO33Q7Z6M2 555 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDE8BO95263 885 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FGFR2P21802 821 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EYA2O00167 538 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C2orf69Q8N8R5 385 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AIDAQ96BJ3 306 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HDAC9Q9UKV0 1011 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LBX1P52954 281 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RGMBQ6NW40 437 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 POTEDQ86YR6 584 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SIL1Q9H173 461 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BCAMP50895 628 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CFAP100Q494V2 611 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TSKSQ9UJT2 592 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP2K2P36507 400 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DLGAP5Q15398 846 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MFSD14BQ5SR56 506 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MTMR14Q8NCE2 650 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OTOFQ9HC10 1997 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MMP14P50281 582 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CLRN2A0PK11 232 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPDYE6P0CI01 402 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TNS4Q8IZW8 715 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FZD1Q9UP38 647 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC10A3P09131 477 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RASAL3Q86YV0 1011 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CIAO1O76071 339 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NOGQ13253 232 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VPS37DQ86XT2 251 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRKG1Q13976 671 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CAVIN4Q5BKX8 364 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COPRSQ9NQ92 184 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LAMB1P07942 1786 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GNAI3P08754 354 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC5A1P13866 664 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FKBP1BP68106 108 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LPIN2Q92539 896 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RLBP1P12271 317 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ADORA1P30542 326 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MTX1Q13505 466 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP2B3Q16720 1220 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VEZTQ9HBM0 779 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FBXO3Q9UK99 471 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SRGAP3O43295 1099 aa18■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CRKP46108 304 aa18■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPDYE2Q495Y8 402 aa18■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CDAN1Q8IWY9 1227 aa18■□□□□ 0.47
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC102AQ96A19 550 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms