RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 CERS5Q8N5B7 392 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 ZNF521Q96K83 1311 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 A0A1B0GUL6 1792 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 F8W031 263 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 SUCLG2Q96I99 432 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 PRKG1Q13976 671 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 UBE4AQ14139 1066 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 CFAP100Q494V2 611 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 E9PSI1 815 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 UTYO14607 1347 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 PTPRCP08575 1304 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 SPDYE6P0CI01 402 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 RGS19P49795 217 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 SREBF2Q12772 1141 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-205ENST00000432588 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.859e-7■■■□□ 17.1
ACTB-205ENST00000432588 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 KAZALD1Q96I82 304 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 JAG2Q9Y219 1238 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 TM4SF4P48230 202 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 CLRN2A0PK11 232 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 VPS37DQ86XT2 251 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 VEZTQ9HBM0 779 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 TBC1D8O95759 1140 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 GYG1P46976 350 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 MAP3K11Q16584 847 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 SPRYD7Q5W111 196 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 UNCXA6NJT0 531 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 TNFAIP1Q13829 316 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 METTL24Q5JXM2 366 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 INHBEP58166 350 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 RASA3Q14644 834 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 FZD1Q9UP38 647 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-205ENST00000432588 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 ALDH1A1P00352 501 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 SLFN5Q08AF3 891 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 LRRC24Q50LG9 513 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 GPR25O00155 361 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 PDE8BO95263 885 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 WNK4Q96J92 1243 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 USP44Q9H0E7 712 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 AOX1Q06278 1338 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 CRKP46108 304 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTB-205ENST00000432588 FKTNO75072 461 aa20.28■□□□□ 0.84
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