RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429574.1

LIN28AP1-201, Transcript of LIN28A pseudogene 1, humanhuman

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Gene LIN28AP1, Length 405 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AP1-201ENST00000429574 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
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LIN28AP1-201ENST00000429574 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
LIN28AP1-201ENST00000429574 JAG2Q9Y219 1238 aa23.65■■□□□ 1.38
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LIN28AP1-201ENST00000429574 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.64■■□□□ 1.37
LIN28AP1-201ENST00000429574 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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LIN28AP1-201ENST00000429574 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
LIN28AP1-201ENST00000429574 SLC10A3P09131 477 aa23.63■■□□□ 1.37
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LIN28AP1-201ENST00000429574 ZIC5Q96T25 663 aa23.62■■□□□ 1.37
LIN28AP1-201ENST00000429574 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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LIN28AP1-201ENST00000429574 CERS5Q8N5B7 392 aa23.61■■□□□ 1.37
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LIN28AP1-201ENST00000429574 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.61■■□□□ 1.37
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LIN28AP1-201ENST00000429574 LRRC24Q50LG9 513 aa23.6■■□□□ 1.37
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LIN28AP1-201ENST00000429574 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.6■■□□□ 1.37
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LIN28AP1-201ENST00000429574 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.59■■□□□ 1.37
LIN28AP1-201ENST00000429574 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
LIN28AP1-201ENST00000429574 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
LIN28AP1-201ENST00000429574 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.59■■□□□ 1.37
LIN28AP1-201ENST00000429574 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
LIN28AP1-201ENST00000429574 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.59■■□□□ 1.37
LIN28AP1-201ENST00000429574 TRPA1O75762 1119 aa23.58■■□□□ 1.37
LIN28AP1-201ENST00000429574 PDE8BO95263 885 aa23.58■■□□□ 1.37
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.58■■□□□ 1.37
LIN28AP1-201ENST00000429574 CLRN2A0PK11 232 aa23.57■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.57■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.57■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.56■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.56■■□□□ 1.36
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SPDYE6P0CI01 402 aa23.56■■□□□ 1.36
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LIN28AP1-201ENST00000429574 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.56■■□□□ 1.36
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LIN28AP1-201ENST00000429574 TNFAIP1Q13829 316 aa23.55■■□□□ 1.36
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LIN28AP1-201ENST00000429574 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 RNF186Q9NXI6 227 aa23.55■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.54■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.54■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 KIF16BQ96L93 1317 aa23.54■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 EYA2O00167 538 aa23.53■■□□□ 1.36
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SLC5A1P13866 664 aa23.53■■□□□ 1.36
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.52■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.52■■□□□ 1.36
LIN28AP1-201ENST00000429574 TNNI2P48788 182 aa23.51■■□□□ 1.35
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LIN28AP1-201ENST00000429574 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 SREBF2Q12772 1141 aa23.51■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 SIL1Q9H173 461 aa23.51■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 CRKP46108 304 aa23.5■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.5■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 LPIN2Q92539 896 aa23.5■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.5■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.5■■□□□ 1.35
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LIN28AP1-201ENST00000429574 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 RASA3Q14644 834 aa23.49■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 GNAI3P08754 354 aa23.48■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
LIN28AP1-201ENST00000429574 TEKT1Q969V4 418 aa23.48■■□□□ 1.35
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