RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 CIAO1O76071 339 aa15.18■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 MTX1Q13505 466 aa15.18■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 OGFOD1Q8N543 542 aa15.18■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM57Q8N5G2 664 aa15.18■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF408Q9H9D4 720 aa15.18■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 COPRSQ9NQ92 184 aa15.18■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.18■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15.18■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 GNAI3P08754 354 aa15.17■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 RLBP1P12271 317 aa15.17■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 BCAMP50895 628 aa15.17■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.17■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.17■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 GRIK5Q16478 980 aa15.16■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 SULF1Q8IWU6 871 aa15.16■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 CDCA5Q96FF9 252 aa15.16■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 CAPNS2Q96L46 248 aa15.16■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 WBP1LQ9NX94 342 aa15.16■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 TRPM7Q96QT4 1865 aa15.16■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 AOX1Q06278 1338 aa15.16■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.15■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 SIL1Q9H173 461 aa15.15■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.15■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RPSAP46-201ENST00000428316 F8W031 263 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.14■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.14■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 LPIN2Q92539 896 aa15.14■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa15.13■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 SRGAP3O43295 1099 aa15.13■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 GNAI2P04899 355 aa15.13■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 ECE1P42892 770 aa15.13■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 DLGAP5Q15398 846 aa15.13■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 CFAP100Q494V2 611 aa15.13■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.13■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.12■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 FOXN1O15353 648 aa15.12■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 AOC2O75106 756 aa15.12■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 SPDYE6P0CI01 402 aa15.12■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 HUNKP57058 714 aa15.12■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 C2orf69Q8N8R5 385 aa15.12■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 ZIC5Q96T25 663 aa15.12■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 ZBTB22O15209 634 aa15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC5A1P13866 664 aa15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 MAP2K2P36507 400 aa15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 TIMM10P62072 90 aa15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 ATP8B2P98198 1209 aa15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 POLA2Q14181 598 aa15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 RGMBQ6NW40 437 aa15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 MOB2Q70IA6 237 aa15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 VPS37DQ86XT2 251 aa15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 MRIQ9BWK5 157 aa15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 ATP2B3Q16720 1220 aa15.1■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 ADORA1P30542 326 aa15.09■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 FKBP1BP68106 108 aa15.09■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 TFCP2Q12800 502 aa15.09■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 GRM1Q13255 1194 aa15.09■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 SSH3Q8TE77 659 aa15.09■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa15.09■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.09■□□□□ 0.01
RPSAP46-201ENST00000428316 CLRN2A0PK11 232 aa15.08■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 PHKA1P46020 1223 aa15.08■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 CRKP46108 304 aa15.08■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 PANK1Q8TE04 598 aa15.08■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 CCDC102BQ68D86 513 aa15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 CCDC102AQ96A19 550 aa15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 C1orf115Q9H7X2 142 aa15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.07■□□□□ 0
RPSAP46-201ENST00000428316 THSD7BQ9C0I4 1608 aa15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms