RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.26■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.26■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.26■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.26■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.25■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 PLIN1O60240 522 aa26.25■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 MOB2Q70IA6 237 aa26.25■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.25■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 NF2P35240 595 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 DLGAP5Q15398 846 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 CSRNP1Q96S65 589 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.22■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.22■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 CCER2I3L3R5 266 aa26.22■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 USP44Q9H0E7 712 aa26.22■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 RNF186Q9NXI6 227 aa26.22■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.21■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.21■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 SPDYE6P0CI01 402 aa26.21■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.21■■□□□ 1.79
UBXN4-204ENST00000426921 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 CFAP100Q494V2 611 aa26.2■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.2■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.2■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 GYG1P46976 350 aa26.19■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.19■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.19■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 JAG2Q9Y219 1238 aa26.19■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.19■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.18■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 F8W031 263 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC24Q50LG9 513 aa26.18■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.18■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 MYO1BO43795 1136 aa26.17■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 TRPA1O75762 1119 aa26.17■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.17■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.17■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.17■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.17■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 PDE8BO95263 885 aa26.16■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 METTL24Q5JXM2 366 aa26.16■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 AOX1Q06278 1338 aa26.15■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 MAP3K11Q16584 847 aa26.15■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.15■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 KIF16BQ96L93 1317 aa26.14■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
UBXN4-204ENST00000426921 CLRN2A0PK11 232 aa26.13■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.13■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 TM4SF4P48230 202 aa26.12■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 DGKZQ13574 1117 aa26.12■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 UNCXA6NJT0 531 aa26.11■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 FGFR2P21802 821 aa26.11■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 PRKG1Q13976 671 aa26.11■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.11■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.11■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 VPS37DQ86XT2 251 aa26.1■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 VEZTQ9HBM0 779 aa26.1■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 LAMB1P07942 1786 aa26.1■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 EYA2O00167 538 aa26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 SREBF2Q12772 1141 aa26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 TNFAIP1Q13829 316 aa26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 SPRYD7Q5W111 196 aa26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 FZD1Q9UP38 647 aa26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC85CA6NKD9 419 aa26.08■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 RASA3Q14644 834 aa26.08■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
UBXN4-204ENST00000426921 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 CRKP46108 304 aa26.07■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 GRIK5Q16478 980 aa26.07■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.07■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 FBXO3Q9UK99 471 aa26.07■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 BCAMP50895 628 aa26.06■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.06■■□□□ 1.76
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms