RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 CEP85Q6P2H3 762 aa15.74■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 EXOC1Q9NV70 894 aa15.74■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.74■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 SSFA2P28290 1259 aa15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 MICALCLQ6ZW33 695 aa15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 Q6ZUG5 572 aa15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 G2E3Q7L622 706 aa15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 PHACTR2O75167 634 aa15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 MCM3P25205 808 aa15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 GDPD2Q9HCC8 539 aa15.73■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 NOD1Q9Y239 953 aa15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 TAF5LO75529 589 aa15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 LMAN1P49257 510 aa15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 GNA11P29992 359 aa15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 DLGAP5Q15398 846 aa15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.72■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 CTNNA2P26232 953 aa15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 STAT6P42226 847 aa15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 CHST3Q7LGC8 479 aa15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 TTC16Q8NEE8 873 aa15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 TCIRG1Q13488 830 aa15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 TRIM47Q96LD4 638 aa15.71■□□□□ 0.11
USP22-201ENST00000261497 CLCN1P35523 988 aa15.71■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 NEMFO60524 1076 aa15.7■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 YEATS4O95619 227 aa15.7■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 DNA2P51530 1060 aa15.7■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 MNAT1P51948 309 aa15.7■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 RPS8P62241 208 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 KRT79Q5XKE5 535 aa15.7■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.7■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 DCTPP1Q9H773 170 aa15.7■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 TRIM75PA6NK02 468 aa15.7■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa15.7■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 TRIM37O94972 964 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 KRT13P13646 458 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 USO1O60763 962 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 SYKP43405 635 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 XAGE2Q96GT9 111 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 RMND1Q9NWS8 449 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 CCDC171Q6TFL3 1326 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 LPIN2Q92539 896 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 ADCY5O95622 1261 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 ISM2Q6H9L7 571 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa15.69■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 AFMP43652 599 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 LUZP1Q86V48 1076 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 C2CD5Q86YS7 1000 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 TCP10Q12799 353 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 CERS3Q8IU89 383 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 KRT222Q8N1A0 295 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 TMX3Q96JJ7 454 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 CHL1O00533 1208 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 ASIC1P78348 528 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 IFFO1Q0D2I5 559 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 SYNCQ9H7C4 482 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.68■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 PHKG2P15735 406 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 TNNI3KQ59H18 835 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 CCDC175P0C221 793 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 SPAG5Q96R06 1193 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 TNNQ9UQP3 1299 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 POTEB2H3BUK9 544 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 GCKRQ14397 625 aa15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms