RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 A0A0G2JK05 382 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 CSN2P05814 226 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 ZNF44P15621 663 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 OR3A4PP47883 348 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 P2RX3P56373 397 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 FOXL1Q12952 345 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 RSU1Q15404 277 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 SPHARQ15513 63 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 TPRX1Q8N7U7 411 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 ZNF714Q96N38 554 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 CHIAQ9BZP6 476 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 FAM192AQ9GZU8 254 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 IL36GQ9NZH8 169 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 FOXJ3Q9UPW0 622 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 CRHBPP24387 322 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 TGFBR2P37173 567 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 IL13RA2Q14627 380 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 OR5M11Q96RB7 305 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 DPAGT1Q9H3H5 408 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 FUOMA2VDF0 154 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 DEGS1O15121 323 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 PAHP00439 452 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 IGHV4-59P01825 116 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 RPL15P61313 204 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 SCN1BQ07699 218 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 AWAT1Q58HT5 328 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 MS4A15Q8N5U1 240 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 PPA2Q9H2U2 334 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 CDRT1O95170 752 aa20.27■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 IGHV1-8P0DP01 117 aa20.27■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 GPR50Q13585 617 aa20.27■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 NHLRC3Q5JS37 347 aa20.27■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 CDH26Q8IXH8 852 aa20.27■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 AJUBAQ96IF1 538 aa20.27■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 METTL9Q9H1A3 318 aa20.27■□□□□ 0.84
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PPK0 400 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 FAM181BA6NEQ2 426 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 PIN1P1O15428 100 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 RGS10O43665 173 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 RPL5P46777 297 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 MED22Q15528 200 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 BEND2Q8NDZ0 799 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 OR10K1Q8NGX5 313 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 DYRK2Q92630 601 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 TNFRSF19Q9NS68 423 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 ING4Q9UNL4 249 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 HTR3BO95264 441 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 OR13D1Q8NGV5 346 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 CORO2AQ92828 525 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 COQ2Q96H96 371 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 S100A13Q99584 98 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 A0A087WXM4 84 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 COX7A1P24310 79 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 CFPP27918 469 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 AESQ08117 197 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 C17orf50Q8WW18 174 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 IFT22Q9H7X7 185 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 TRAV24A0A0B4J272 114 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 ODAMA1E959 279 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 CSTBP04080 98 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 GLIPR1P48060 266 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 TAF9Q16594 264 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 PIGYQ3MUY2 71 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 KRBOX4Q5JUW0 171 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 LYPD6Q86Y78 171 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 OSR2Q8N2R0 312 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 C3orf56Q8N813 242 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 NKAIN3Q8N8D7 197 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 OR11H6Q8NGC7 330 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 OR5R1Q8NH85 324 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 MEGF9Q9H1U4 602 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 TAS2R3Q9NYW6 316 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 ST3GAL6Q9Y274 331 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 SESN1Q9Y6P5 492 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 FBN3Q75N90 2809 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 ODF3BA8MYP8 253 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 CLPXO76031 633 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 MAS1P04201 325 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 CRYBA1P05813 215 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 LGALS4P56470 323 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 RBM11P57052 281 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 PAX5Q02548 391 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 ACSM3Q53FZ2 586 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-220ENST00000618056 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms