RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 SERPINA5P05154 406 aa13.07□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 OPN1MW3P0DN78 364 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 AGTR1P30556 359 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 B3GALT5-AS1P59052 145 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 S100A10P60903 97 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 MMP26Q9NRE1 261 aa13.07□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 ICE1Q9Y2F5 2266 aa13.07□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 MITD1Q8WV92 249 aa13.07□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 PTX4Q96A99 478 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 SNHG12Q9BXW3 62 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 OR5AC2Q9NZP5 309 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 CRIM1Q9NZV1 1036 aa13.06□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 SOD3P08294 240 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 DUSP1P28562 367 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 ZNF92Q03936 586 aa13.06□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 HIST2H3AQ71DI3 136 aa13.06□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 S100A7P31151 101 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 SLC16A14Q7RTX9 510 aa13.05□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 SH2D2AQ9NP31 389 aa13.05□□□□□ -0.32
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CTIF-205ENST00000587860 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 IGKV1D-12P01611 117 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 RAC3P60763 192 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 MST1LQ2TV78 715 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 DHRS13Q6UX07 377 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-205ENST00000587860 ZNF664Q8N3J9 261 aa13.04□□□□□ -0.32
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