RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MYO7AQ13402 2215 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PPE2 198 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SMCO3A2RU48 225 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ARGFXA6NJG6 315 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 J3QW42 95 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SYNGR3O43761 229 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 EFNA2O43921 213 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TUSC2O75896 110 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 GCGP01275 180 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR13C7P0DN81 318 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 BCL2P10415 239 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SRFP11831 508 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LIFP15018 202 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 AADACP22760 399 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CDAP32320 146 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CEACAM6P40199 344 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HAAOP46952 286 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1D5P58170 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FGF12P61328 243 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 IL11RAQ14626 422 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ICAM4Q14773 271 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP6V1FQ16864 119 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OTPQ5XKR4 325 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CARD17Q5XLA6 110 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 REC114Q7Z4M0 266 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NAT6Q93015 286 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 WNT2BQ93097 391 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ISOC2Q96AB3 205 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM210BQ96KR6 192 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RASL10BQ96S79 203 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 WFDC1Q9HC57 220 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF724A8MTY0 619 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP5D1E7EU14 171 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC01565O15544 149 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SCRG1O75711 98 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 VENTXO95231 258 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NAPSAO96009 420 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LCATP04180 440 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ARG1P05089 322 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CD99P14209 185 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SRD5A2P31213 254 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CCKARP32238 428 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SSR4P51571 173 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FXYD4P59646 89 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CCL7P80098 99 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NHLH2Q02577 135 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF92Q03936 586 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PRDX4Q13162 271 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 IGSF11Q5DX21 431 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ACER2Q5QJU3 275 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf189Q5VU69 101 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM45BQ96B21 275 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5B12Q96R08 314 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 IER2Q9BTL4 223 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 STRADBQ9C0K7 418 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CALHM2Q9HA72 323 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 Q9N2K0 584 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MANBALQ9NQG1 85 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms