RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 MITD1Q8WV92 249 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 RND1Q92730 232 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 G3V3Q6 166 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 GSTT2P0CG29 244 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 CASP6P55212 293 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF146Q15072 292 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 MSMPQ1L6U9 139 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 C2orf68Q2NKX9 166 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 SUMF2Q8NBJ7 301 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 FZR1Q9UM11 496 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 NBASA2RRP1 2371 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRAV24A0A0B4J272 114 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM221AA4D161 298 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 HLA-GP17693 338 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPS23P62266 143 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2T35Q8NGX2 323 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q9N2K0 584 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 MEMO1Q9Y316 297 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 GRPP07492 148 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 GNLYP22749 145 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD40P25942 277 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 DUSP1P28562 367 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 H2BFSP57053 126 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL13RA1P78552 427 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFITM2Q01629 132 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPIN3Q5JUX0 258 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM171Q8WVE6 324 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF462Q96JM2 2506 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 F5H5P2 479 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC22A5O76082 557 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNASE1P24855 282 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 SHEQ5VZ18 495 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC22A25Q6T423 547 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR11H4Q8NGC9 324 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM230Q96A57 120 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM172BPA6NC97 362 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD34P28906 385 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 UQCRFS1P47985 274 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 LPCAT3Q6P1A2 487 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 MSL2Q9HCI7 577 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 TREM2Q9NZC2 230 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 GOSR2O14653 212 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 DEGS1O15121 323 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 RGS11O94810 467 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPP3CBP16298 524 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKR1C4P17516 323 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 C9orf62Q8N4C0 152 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 UXS1Q8NBZ7 420 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR13Q9H1Z4 485 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 OPN4Q9UHM6 478 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 MGAT4AQ9UM21 535 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 RGS13O14921 159 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 NXPH2O95156 264 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD200P41217 278 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 CA7P43166 264 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 ALKBH2Q6NS38 261 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 NUP37Q8NFH4 326 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 PHB2Q99623 299 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHIAQ9BZP6 476 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 LIME1Q9H400 295 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLSCR3Q9NRY6 295 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 BOLA1Q9Y3E2 137 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTAFRP25105 342 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 MDH2P40926 338 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 LY6G6FQ5SQ64 297 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF880Q6PDB4 577 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM108Q6UXF1 575 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRR7Q8TB68 274 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A0B4J2A0 478 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR82Q6UXN9 313 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRP11Q86VZ4 500 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5M8Q8NGP6 311 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 SHPKQ9UHJ6 478 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLEQ07864 2286 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 DBX1A6NMT0 343 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 SFT2D2O95562 160 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIR2DS4P43632 304 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIR2DS1Q14954 304 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q5BKY6 102 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 GAPTQ8N292 157 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms