RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556355.5

SRP54-AS1-203, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 603 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-203ENST00000556355 AHSA2Q719I0 299 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NELFBQ8WX92 580 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC25A46Q96AG3 418 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 L3HYPDHQ96EM0 354 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C18orf15Q96N68 181 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DIABLOQ9NR28 239 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DDIT4Q9NX09 232 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SCN4AP35499 1836 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BCORQ6W2J9 1755 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C2orf16Q68DN1 1984 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SCN7AQ01118 1682 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF831Q5JPB2 1677 aa2.76□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RTL1A6NKG5 1358 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FLT4P35916 1363 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 A0A0G2JMP0 313 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 A0A0X1KG70 313 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UBDO15205 165 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CRXO43186 299 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HLA-DQB1P01920 261 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CD74P04233 296 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR4Q2P0C623 313 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HLA-GP17693 338 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IL3RAP26951 378 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HTR2BP41595 481 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MAGEA3P43357 314 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RAB38P57729 211 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR2B6P58173 313 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GRB2P62993 217 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PMVKQ15126 192 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CLEC19AQ6UXS0 136 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SSX7Q7RTT5 188 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CYP4Z1Q86W10 505 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BBS7Q8IWZ6 715 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCNYL1Q8N7R7 359 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR5T1Q8NG75 326 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR4K17Q8NGC6 315 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR5M1Q8NGP8 315 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ORAOV1Q8WV07 137 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SMIM8Q96KF7 97 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR10C1Q96KK4 312 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DOK1Q99704 481 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BBS2Q9BXC9 721 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SDHAF3Q9NRP4 125 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ENPP5Q9UJA9 477 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RFNGQ9Y644 331 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 USH1CQ9Y6N9 552 aa2.75□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UBR2Q8IWV8 1755 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 AKAP11Q9UKA4 1901 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UPK2O00526 184 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SGCEO43556 437 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TNFAIP8O95379 198 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCNE2O96020 404 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IGLV2-8P01709 118 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IGLV3-25P01717 112 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MAS1P04201 325 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LINC00869P0C866 280 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UGT2B10P36537 528 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TUFMP49411 452 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC18A1P54219 525 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DMC1Q14565 340 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TRAM1Q15629 374 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCL15Q16663 113 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DEFB115Q30KQ5 88 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SPATA24Q86W54 205 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IQCF2Q8IXL9 164 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GAPTQ8N292 157 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SPICQ8N5J4 248 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ACBD4Q8NC06 268 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR13G1Q8NGZ3 307 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FRZBQ92765 325 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 S100PBPQ96BU1 408 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 STARD4Q96DR4 205 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.971e-8■■■■■ 41.6
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DSN1Q9H410 356 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IFT46Q9NQC8 304 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MS4A12Q9NXJ0 267 aa2.74□□□□□ -1.97
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C21orf62Q9NYP8 219 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms