RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 HOXA6P31267 233 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 HRH1P35367 487 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PPOXP50336 477 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ARG2P78540 354 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PPP1R1AQ13522 171 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CRMP1Q14194 572 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OR6X1Q8NH79 312 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ASB10Q8WXI3 467 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SLC35E1Q96K37 410 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 IP6K3Q96PC2 410 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ABI3Q9P2A4 366 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 LMO7DNF2Z398 122 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OR4N5Q8IXE1 308 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 C10orf35Q96D05 121 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC61Q9BV99 259 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 A6NJY4 79 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SSSCA1O60232 199 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 NPY1RP25929 384 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PLGLAQ15195 96 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OR1Q1Q15612 314 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PRR18Q8N4B5 295 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OR10W1Q8NGF6 305 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 FBXL17Q9UF56 701 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 DUX1O43812 170 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 FGF17O60258 216 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 TUSC5Q8IXB3 177 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 RAB37Q96AX2 223 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 TMEM262E9PQX1 116 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM250H0YL14 139 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 ID4P47928 161 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 UCP3P55916 312 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SELENOVP59797 346 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 PNLIPP16233 465 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CUTCQ9NTM9 273 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 RABAC1Q9UI14 185 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 B4DGG1 531 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 H0Y8X5 98 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 EML2O95834 649 aa5.36□□□□□ -1.55
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