RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 CD226Q15762 336 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 FGGYQ96C11 551 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 SMPXQ9UHP9 88 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 C22orf46C9J442 243 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 LMO7DNF2Z398 122 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 K7ERU9 68 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ABHD16AO95870 558 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CTRLP40313 264 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CBLN3Q6UW01 205 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZVH6 145 aa7.38□□□□□ -1.23
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TRPS1-209ENST00000519674 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF320A2RRD8 509 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 FAM221AA4D161 298 aa7.38□□□□□ -1.23
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TRPS1-209ENST00000519674 C9orf172C9J069 976 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 H0YIG0 161 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CD55P08174 381 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 MYF5P13349 255 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 OR1D5P58170 312 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 S100A7AQ86SG5 101 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PRR22Q8IZ63 422 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM234Q8WY98 164 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PTX4Q96A99 478 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 NMNAT3Q96T66 252 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PLK3Q9H4B4 646 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TACSTD2P09758 323 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ARL4DP49703 201 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF92Q03936 586 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TCF24Q7RTU0 167 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 RASD2Q96D21 266 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 LOXL4Q96JB6 756 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 NUDT9Q9BW91 350 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 FBXO45P0C2W1 286 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 FAHP16930 419 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 BIDP55957 195 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 NXPH1P58417 271 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ELOA3Q8NG57 546 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 RASL10BQ96S79 203 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ADOQ96SZ5 270 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM212A6NML5 194 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 C4orf47A7E2U8 309 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PROB1E7EW31 1015 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TYMSP04818 313 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TNFSF4P23510 183 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 DMWDQ09019 674 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 MPV17LQ2QL34 196 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZWC4 215 aa7.37□□□□□ -1.23
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