RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 OR51A2Q8NGJ7 313 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 ODAMA1E959 279 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC159P0C7I6 412 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 OCM2P0CE71 109 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 CDK2P24941 298 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF691Q5VV52 312 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 ELP2Q6IA86 826 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 DTX3Q8N9I9 347 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 CHST4Q8NCG5 386 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 OR5D14Q8NGL3 314 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 NEK6Q9HC98 313 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 F2RL2O00254 374 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 OPN1MWP04001 364 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 HCKP08631 526 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 OPN1MW2P0DN77 364 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 OPN1MW3P0DN78 364 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 CGB3P0DN86 165 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 CGB7P0DN87 165 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF44P15621 663 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 HTR1DP28221 377 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 BDH1Q02338 343 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 SLC34A1Q06495 639 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 C17orf58Q2M2W7 97 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 LPCAT4Q643R3 524 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 ABHD12Q8N2K0 398 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 NDNFQ8TB73 568 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF286AQ9HBT8 521 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 DHDHQ9UQ10 334 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 NOTCH3Q9UM47 2321 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 A0A087X0M5 115 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1B0GX30 115 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 FAM172BPA6NC97 362 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM225BP0DP42 221 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 CD28P10747 220 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 SCN1BQ07699 218 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 RTN4RL2Q86UN3 420 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 Q8NFD4 153 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 PXT1Q8NFP0 134 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 OR51T1Q8NGJ9 327 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 PRSS22Q9GZN4 317 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 FUOMA2VDF0 154 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 GABRPO00591 440 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 MTNR1BP49286 362 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 ETV1P50549 477 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM95Q3KNT9 176 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL22Q53GT1 634 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 KRBOX4Q5JUW0 171 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 OR52W1Q6IF63 320 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 LYG1Q8N1E2 194 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 OCSTAMPQ9BR26 566 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 DPM3Q9P2X0 92 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 TRAV24A0A0B4J272 114 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 LY6LH3BQJ8 138 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 ASCL4Q6XD76 172 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 RDH12Q96NR8 316 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 TAS2R4Q9NYW5 299 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB3-211ENST00000490677 DEGS1O15121 323 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 FBXO24O75426 580 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 CD24P25063 80 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 PTGFRP43088 359 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 ZSCAN26Q16670 478 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 BEAN1Q3B7T3 259 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 OR2G6Q5TZ20 316 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 G3V4G9 280 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 H0YJX3 145 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 CLIC3O95833 236 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 RAB3AP20336 220 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 SOX2P48431 317 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 HLA-DRB5Q30154 266 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC58Q4VC31 144 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 SAMD5Q5TGI4 173 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF596Q8TC21 504 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 ING3Q9NXR8 418 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF581Q9P0T4 197 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 EBAG9O00559 213 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 LALBAP00709 142 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 PAX5Q02548 391 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 CNIH3Q8TBE1 160 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 KIRREL1Q96J84 757 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 OR5M11Q96RB7 305 aa22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms