RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

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Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 SRRM5B3KS81 715 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 SIRPB1O00241 398 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 OR5AP2Q8NGF4 316 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 SLC2A8Q9NY64 477 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 ETAA1Q9NY74 926 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 TNFRSF1AP19438 455 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 CCL8P80075 99 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 ZMYND11Q15326 602 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 CARTPTQ16568 116 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 FAM209AQ5JX71 171 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 MS4A5Q9H3V2 200 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 FLVCR2Q9UPI3 526 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 ARPC4P59998 168 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 TESK1Q15569 626 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 AGAP6Q5VW22 663 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 FAM90A1Q86YD7 464 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 EGLN1Q9GZT9 426 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-210ENST00000489475 ANXA10Q9UJ72 324 aa22.58■■□□□ 1.21
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HOXB3-210ENST00000489475 ARRDC1Q8N5I2 433 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 GCSAMQ8N6F7 178 aa22.57■■□□□ 1.2
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HOXB3-210ENST00000489475 ZNF286AQ9HBT8 521 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 DECR2Q9NUI1 292 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 RNF7Q9UBF6 113 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 DNAJB11Q9UBS4 358 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 NPTNQ9Y639 398 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa22.57■■□□□ 1.2
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HOXB3-210ENST00000489475 MST1LQ2TV78 715 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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HOXB3-210ENST00000489475 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa22.56■■□□□ 1.2
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HOXB3-210ENST00000489475 LHBP01229 141 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 EGR1P18146 543 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 MDH2P40926 338 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 TSPAN5P62079 268 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM17Q86X19 198 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 MUC15Q8N387 334 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 Q8TCH9 128 aa22.56■■□□□ 1.2
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HOXB3-210ENST00000489475 EHFQ9NZC4 300 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 PKDREJQ9NTG1 2253 aa22.55■■□□□ 1.2
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HOXB3-210ENST00000489475 PPA2Q9H2U2 334 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 SAP30LQ9HAJ7 183 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 TREM2Q9NZC2 230 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 CACNA1DQ01668 2161 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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HOXB3-210ENST00000489475 IRF2P14316 349 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 LMO1P25800 156 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 RBMXP38159 391 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 SHEQ5VZ18 495 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 WIPI2Q9Y4P8 454 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 RLN1P04808 185 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 OVCH2Q7RTZ1 564 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 GIMAP1Q8WWP7 306 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 HPS1Q92902 700 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM165Q9HC07 324 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 H7C1Q1 480 aa22.53■■□□□ 1.2
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HOXB3-210ENST00000489475 SWI5Q1ZZU3 235 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 Q6ZPA2 131 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 OR5T2Q8NGG2 359 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 OR13C8Q8NGS7 320 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 Q9N2K0 584 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 NECAP2Q9NVZ3 263 aa22.53■■□□□ 1.2
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HOXB3-210ENST00000489475 OR2AT4A6NND4 320 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 C19orf84I3L1E1 186 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 PRAF2O60831 178 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 PRDX2P32119 198 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 GRK1Q15835 563 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 Q6ZS49 121 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 TERB2Q8NHR7 220 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 BEX2Q9BXY8 128 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 BEX1Q9HBH7 125 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 PSG2P11465 335 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 NEURL2Q9BR09 285 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-210ENST00000489475 A0A0A6YYJ9 748 aa22.51■■□□□ 1.19
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