RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-215ENST00000476784 RASL10BQ96S79 203 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MYO5BQ9ULV0 1848 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 OR4C46A6NHA9 309 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PRR33A8MZF0 331 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 COL10A1Q03692 680 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 AESQ08117 197 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TMEM177Q53S58 311 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CALHM1Q8IU99 346 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NUDT11Q96G61 164 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 VSTM2LQ96N03 204 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CA10Q9NS85 328 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TREX1Q9NSU2 369 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 J3QR89 54 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 UPK1AO00322 258 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 EFNB1P98172 346 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 VAMP3Q15836 100 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LYG2Q86SG7 212 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 R3HDM4Q96D70 268 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 FAAP24Q9BTP7 215 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.9□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 G3V2L1 256 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 GPX1P07203 203 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 CD96P40200 585 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 ZNF117Q03924 483 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 CFAP161Q6P656 301 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 PAQR9Q6ZVX9 377 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 OR6X1Q8NH79 312 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 ZG16BQ96DA0 208 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 CXorf65A6NEN9 183 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 J3QKU1 62 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 PNPP00491 289 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 INHBBP09529 407 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 FAM71E1Q6IPT2 247 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 FUCA1P04066 466 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 DAOP14920 347 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 GNLYP22749 145 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 COL8A1P27658 744 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 SLC37A1P57057 533 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 CD226Q15762 336 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 GGTA1PQ4G0N0 100 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 HCP5Q6MZN7 132 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 RHBDD2Q6NTF9 364 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 ALKAL1Q6UXT8 129 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 TMEM18Q96B42 140 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 KCNK15Q9H427 330 aa5.9□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 AHRRA9YTQ3 701 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 B4GALT3O60512 393 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 CLDN14O95500 239 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 TSPOP30536 169 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 MAS1LP35410 378 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 CD81P60033 236 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 TEAD3Q99594 435 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 FCMRO60667 390 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 SLC17A1Q14916 467 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 STPG3Q8N7X2 389 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 A0A1W2PPQ1 181 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 ZNF688P0C7X2 276 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 GUCA2AQ02747 115 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 ANKRD60Q9BZ19 345 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 PIPOXQ9P0Z9 390 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 PEMTQ9UBM1 199 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 GPX3P22352 226 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 PSG6Q00889 435 aa5.89□□□□□ -1.47
TTC3-215ENST00000476784 EGR3Q06889 387 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms