RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1D-16P01601 117 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CT62P0C5K7 136 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CD33P20138 364 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OMGP23515 440 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10J1P30954 320 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CCKARP32238 428 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CXCL12P48061 93 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 NNATQ16517 81 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TDRG1Q3Y452 100 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 METRNLQ641Q3 311 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 LYPD6Q86Y78 171 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 DPF1Q92782 380 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PP11 408 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf98E9PRG8 122 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL25O15444 150 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 VIPR2P41587 438 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF117Q03924 483 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF74Q16587 644 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB42Q8N4Z0 105 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 GATSQ8NAP1 163 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CFHR4Q92496 578 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TP53RKQ96S44 253 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 GNG13Q9P2W3 67 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 DEC1Q9P2X7 70 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP192Q8TEP8 1941 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CBY3A6NI87 242 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP5D1E7EU14 171 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 KAT7O95251 611 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 DDAH2O95865 285 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF883P0CG24 379 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 GZMHP20718 246 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB28P51157 221 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 RUNX2Q13950 521 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR157Q5UAW9 335 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ERASQ7Z444 233 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CACUL1Q86Y37 369 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5T1Q8NG75 326 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 RLN3Q8WXF3 142 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ACY3Q96HD9 319 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD6Q9BV23 337 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GUS0 222 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP92A6NM28 416 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ST8SIA3O43173 380 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 UMODP07911 640 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 DBHP09172 617 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 H2BFMP0C1H6 154 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 NTSR1P30989 418 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PDLIM4P50479 330 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 RUNX1Q01196 453 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 NHLH1Q02575 133 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ADOQ96SZ5 270 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CALHM2Q9HA72 323 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF318Q5VUA4 2279 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TRDCB7Z8K6 153 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF17O60258 216 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC16A7O60669 478 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CTSVO60911 334 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 MPZL1O95297 269 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 BRI3O95415 125 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ADH1BP00325 375 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5J2P56134 94 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM50BP56557 158 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 IL22RA2Q969J5 263 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A10Q96PG2 267 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms