RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 MISP3Q96FF7 219 aa13.37□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 FAM210BQ96KR6 192 aa13.37□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PLEK2Q9NYT0 353 aa13.37□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PROB1E7EW31 1015 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 RRP8O43159 456 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PATE4P0C8F1 98 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 FUT3P21217 361 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 MPV17LQ2QL34 196 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 GUSBP11Q6P575 273 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 METTL9Q9H1A3 318 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CALHM2Q9HA72 323 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 NCOR1O75376 2440 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ST8SIA5O15466 376 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 HLA-HP01893 362 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ECI1P42126 302 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SSTP61278 116 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 GRB2P62993 217 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 VAMP2P63027 116 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 OR6C1Q96RD1 312 aa13.36□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ADAM20O43506 726 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 HERV-K104P61576 105 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM252Q8N6L7 170 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PLPP5Q8NEB5 264 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 OR4D5Q8NGN0 318 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 P4HTMQ9NXG6 502 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SIT1Q9Y3P8 196 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM50AO95807 157 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SPINK2P20155 84 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 GLIPR1P48060 266 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 PLPPR5Q32ZL2 321 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SLC16A14Q7RTX9 510 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 REC114Q7Z4M0 266 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 DPPA2Q7Z7J5 298 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CMTM1Q8IZ96 169 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 NECAP1Q8NC96 275 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 A0A087WZY1 265 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 A0A1W2PNV4 684 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 K7ESF4 209 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 M0R135 149 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SHBQ15464 509 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CYB5R2Q6BCY4 276 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 LCN15Q6UWW0 184 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF695Q8IW36 515 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 DNASE2BQ8WZ79 361 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF799Q96GE5 643 aa13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 TUBG1P23258 451 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 IL2RGP31785 369 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF266Q14584 549 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 Q6ZPA2 131 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 OR6X1Q8NH79 312 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 MVB12AQ96EY5 273 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SYT3Q9BQG1 590 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF442Q9H7R0 627 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 KIAA1456Q9P272 454 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 NPIPB13A6NJU9 1138 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 NPIPB4C9JG80 1138 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 TSTD3H0UI37 97 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 HSPB6O14558 160 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SLC31A2O15432 143 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 IGKV1D-12P01611 117 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 CD200P41217 278 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 HLA-DRB3P79483 266 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 SLC25A24Q6NUK1 477 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 THNSL2Q86YJ6 484 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 DECR2Q9NUI1 292 aa13.34□□□□□ -0.27
SFRP4-201ENST00000436072 G3V3Y1 287 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 HSPA12AO43301 675 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SSX2Q16385 188 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CLDND2Q8NHS1 167 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 OXGR1Q96P68 337 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H2BLQ99880 126 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ST3GAL6Q9Y274 331 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 V9GYS6 101 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SMCO3A2RU48 225 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CD55P08174 381 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 MSR1P21757 451 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ALDH3B1P43353 468 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PKIAP61925 76 aa13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ODF3L1Q8IXM7 274 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87 ms