RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 GLIPR1P48060 266 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZP1P60852 638 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 AESQ08117 197 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 Q6P435 159 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINA12Q8IW75 414 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 OR5D18Q8NGL1 313 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 R3HDM4Q96D70 268 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 SPACA5Q96QH8 159 aa16.8■□□□□ 0.28
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LIMS1-208ENST00000428064 TMEM212A6NML5 194 aa16.79■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 SULT1B1O43704 296 aa16.79■□□□□ 0.28
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LIMS1-208ENST00000428064 CD83Q01151 205 aa16.79■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DRB5Q30154 266 aa16.79■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa16.79■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 RNF144BQ7Z419 303 aa16.79■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 OR5D14Q8NGL3 314 aa16.79■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa16.79■□□□□ 0.28
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LIMS1-208ENST00000428064 OR5M11Q96RB7 305 aa16.79■□□□□ 0.28
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LIMS1-208ENST00000428064 OOSP1A8MZH6 123 aa16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 MPZL2O60487 215 aa16.78■□□□□ 0.28
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LIMS1-208ENST00000428064 CDK5R1Q15078 307 aa16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 KISS1Q15726 138 aa16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM95Q3KNT9 176 aa16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 KRBOX4Q5JUW0 171 aa16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ELP2Q6IA86 826 aa16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 OR4D6Q8NGJ1 314 aa16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF649Q9BS31 505 aa16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF286AQ9HBT8 521 aa16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.78■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 LY6LH3BQJ8 138 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZFPL1O95159 310 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 FADS2O95864 444 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 HCKP08631 526 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC159P0C7I6 412 aa16.77■□□□□ 0.28
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LIMS1-208ENST00000428064 OXLD1Q5BKU9 147 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa16.77■□□□□ 0.28
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LIMS1-208ENST00000428064 PXT1Q8NFP0 134 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 CAPSLQ8WWF8 208 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 STMN2Q93045 179 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 Q96MT0 163 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 NECAP2Q9NVZ3 263 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ERVK13-1Q9NX77 482 aa16.77■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 DEGS1O15121 323 aa16.76■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 PRRX1P54821 245 aa16.76■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf58Q2M2W7 97 aa16.76■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa16.76■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF529Q6P280 563 aa16.76■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 WFDC9Q8NEX5 89 aa16.76■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 RHOXF1Q8NHV9 184 aa16.76■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A33Q9BSK2 321 aa16.76■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 DHDHQ9UQ10 334 aa16.76■□□□□ 0.27
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LIMS1-208ENST00000428064 TOR1AO14656 332 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 PIN1P1O15428 100 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 CGB3P0DN86 165 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 CGB7P0DN87 165 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM225BP0DP42 221 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 SCN1BQ07699 218 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF691Q5VV52 312 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 Q8NFD4 153 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 OR5AK2Q8NH90 309 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00574Q9H8X3 128 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 AASSQ9UDR5 926 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM172BPA6NC97 362 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 H0YJX3 145 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 AMY1AP04745 511 aa16.74■□□□□ 0.27
LIMS1-208ENST00000428064 AMY2AP04746 511 aa16.74■□□□□ 0.27
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