RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2QL1A1L167 161 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 F8VVB4 439 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 F8VWA3 439 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 OR2H2O95918 312 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 HAND1O96004 215 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 IL5P05113 134 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 CSN2P05814 226 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 GZMHP20718 246 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 PRDX2P32119 198 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 BCAP31P51572 246 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 RAB25P57735 213 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 TSPAN5P62079 268 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 C11orf88Q6PI97 169 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF561Q8N587 486 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC107Q8WV48 283 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 Q9N2K0 584 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 DLL4Q9NR61 685 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 ETAA1Q9NY74 926 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 ZZEF1O43149 2961 aa8.1□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 OR2AT4A6NND4 320 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 TRDCB7Z8K6 153 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 HS3ST1O14792 307 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 PFDN1O60925 122 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 MT-ND4P03905 459 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 AMY2AP04746 511 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 FCGR3AP08637 254 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF735P0CB33 412 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 BTCP35070 178 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 ARPC4P59998 168 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 NEK7Q8TDX7 302 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 SNAPC3Q92966 411 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF488Q96MN9 340 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 PPA2Q9H2U2 334 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM165Q9HC07 324 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-211ENST00000425989 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 FAM221AA4D161 298 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 RFPL4AA6NLU0 287 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 PPIAL4DF5H284 164 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 LGALS8O00214 317 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 MGST3O14880 152 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 PEX14O75381 377 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 PSG2P11465 335 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 SPNP16150 400 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 HRH1P35367 487 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 UCP3P55916 312 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 TAS2R31P59538 309 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 CR1LQ2VPA4 569 aa8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-211ENST00000425989 HFEQ30201 348 aa8.08□□□□□ -1.12
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