RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A7PA6NKC0 464 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A22PA8MWA6 464 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR3DP1A8MWS1 328 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A12PA8MX19 464 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 YPEL1O60688 119 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A15PP0C7V4 464 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A13PP0C7W8 464 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A14PP0C7W9 464 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM90A24PP0C7X0 464 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL3P10147 92 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LIFP15018 202 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMC6Q6NXE6 501 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NANPQ8TBE9 248 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 YPEL2Q96QA6 119 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CXorf65A6NEN9 183 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GLB1P16278 677 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R46P59540 309 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LRBAP50851 2863 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CYC1P08574 325 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 COX6A1P12074 109 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OPRM1P35372 400 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RHEBQ15382 184 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NRN1LQ496H8 165 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35G3Q8N808 338 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR54Q9H977 334 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.1□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NKX2-6A6NCS4 301 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R135 149 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 VAMP5O95183 116 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TYMSP04818 313 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RFPL3SP0C7P2 107 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PIGYQ3MUY2 71 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 IGSF11Q5DX21 431 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DNM1P34Q6PK57 102 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP82Q8N141 532 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SAP25Q8TEE9 199 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF799Q96GE5 643 aa3.09□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 EHFQ9NZC4 300 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DMRT1Q9Y5R6 373 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS46E5RG02 174 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 AGPAT2O15120 278 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PDCD6O75340 191 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PPYP01298 95 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PDLIM4P50479 330 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RUNX1Q01196 453 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL6IP1Q15041 203 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB35Q15286 201 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 MTCH1Q9NZJ7 389 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A20A6NK97 555 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DIRAS3O95661 229 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OPN1LWP04000 364 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM225BP0DP42 221 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 IL13RA2Q14627 380 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.09□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PADI1Q9ULC6 663 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 MED6O75586 246 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GLI4P10075 376 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF823P16415 610 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PSG4Q00888 419 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM57BQ71RH2 274 aa3.09□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RABEPKQ7Z6M1 372 aa3.09□□□□□ -1.91
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