RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414879.5

PTPRF-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 2

Gene PTPRF, Length 4,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ST8SIA2	Q92186	375 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	NMES1	Q9C002	83 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	TINAG	Q9UJW2	476 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	CDIPT	O14735	213 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	CCL2	P13500	99 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	FGF12	P61328	243 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	PPP1R1A	Q13522	171 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	KCNMB1	Q16558	191 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	STUM	Q69YW2	141 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879		V9GYH0	126 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	NIN	Q8N4C6	2090 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ID4	P47928	161 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	IL24	Q13007	206 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	TESK1	Q15569	626 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	SHISA5	Q8N114	240 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	FADS6	Q8N9I5	356 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879		H3BMH7	237 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	LIMK1	P53667	647 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	RNF122	Q9H9V4	155 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	IL17B	Q9UHF5	180 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	INSL4	Q14641	139 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM230	Q96A57	120 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	OR2D2	Q9H210	308 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	HSF4	Q9ULV5	492 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	PLXNA3	P51805	1871 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	POM121C	A8CG34	1229 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	TRIM77	I1YAP6	450 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	TIAF1	O95411	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	SKA3	Q8IX90	412 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	MED9	Q9NWA0	146 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	FCGR3B	O75015	233 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ALX3	O95076	343 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	KRAS	P01116	189 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	BCL3	P20749	454 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879		Q3ZCU0	254 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	TMED6	Q8WW62	240 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	GPR27	Q9NS67	375 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	IL36G	Q9NZH8	169 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	COX7A2P2	O60397	106 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	PPY	P01298	95 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	IAPP	P10997	89 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879		Q6ZT83	130 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	PRR7	Q8TB68	274 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	GNB4	Q9HAV0	340 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	PRND	Q9UKY0	176 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	S100A8	P05109	93 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	INHBB	P09529	407 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	PMEL	P40967	661 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879		A0A0U1RQK1	487 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	YIF1A	O95070	293 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	OR5G3	P0C626	314 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	GLI4	P10075	376 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	P2RY1	P47900	373 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRF-205	ENST00000414879	OR8G5	Q8NG78	346 aa		10.42	□□□□□ -0.74

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