RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 SRD5A3Q9H8P0 318 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 A4GALTQ9NPC4 353 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 MYNNQ9NPC7 610 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 SLC17A5Q9NRA2 495 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 DDIT4Q9NX09 232 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 P4HTMQ9NXG6 502 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 PLEK2Q9NYT0 353 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 TVP23BQ9NYZ1 205 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 RHCGQ9UBD6 479 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 SLC7A11Q9UPY5 501 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 OARD1Q9Y530 152 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 SNX10Q9Y5X0 201 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 FANCMQ8IYD8 2048 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-202ENST00000367364 A0A087WZY1 265 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TRBC2A0A5B9 178 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 C20orf202A1L168 122 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 MGAT4DA6NG13 374 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 LOC730098B7Z3J9 87 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 UMAD1C9J7I0 102 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CXCL11O14625 94 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 HSD17B6O14756 317 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ATP6V0E1O15342 81 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 FLRT2O43155 660 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF208O43345 1280 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 RAMP3O60896 148 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJB6O75190 326 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ARL6IP5O75915 188 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TNFSF15O95150 251 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 VAMP5O95183 116 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SOX14O95416 240 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 EPPINO95925 133 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CST4P01036 141 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TRBC1P01850 177 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 IGHEP01854 428 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TRGC2P03986 189 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 RPN2P04844 631 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 FGF1P05230 155 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CST2P09228 141 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR8U9P0C7N5 309 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SEC11BP0C7V7 166 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 DANCRP0C864 163 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PGA3P0DJD8 388 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 GP9P14770 177 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PGAM2P15259 253 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR10J1P30954 320 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CEACAM3P40198 252 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 AQP2P41181 271 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 AKR1C3P42330 323 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR1E2P47887 323 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR3A2P47893 321 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SLC11A1P49279 550 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 FHITP49789 147 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 RAB7AP51149 207 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 LBX1P52954 281 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A1P53007 311 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 EMP2P54851 167 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 HBA1P69905 142 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 H3F3AP84243 136 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 HTD2P86397 168 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CYCSP99999 105 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF85Q03923 595 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 RBPJQ06330 500 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CDK5R1Q15078 307 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 NSDHLQ15738 373 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TAF9Q16594 264 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 GUK1Q16774 197 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 C5orf64Q2M2E5 130 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PGGHGQ32M88 737 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PCGF3Q3KNV8 242 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ACSM3Q53FZ2 586 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ETFRF1Q6IPR1 90 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 NOXRED1Q6NXP6 359 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 NIPAL3Q6P499 406 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PRSS54Q6PEW0 395 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 IGFL3Q6UXB1 125 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF683Q8IZ20 524 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CLECL1Q8IZS7 167 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CPXCR1Q8N123 301 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SYS1Q8N2H4 156 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 RNF175Q8N4F7 328 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 FAM89BQ8N5H3 189 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf42Q8N5U0 333 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 C10orf53Q8N6V4 93 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 LFNGQ8NES3 379 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR4D6Q8NGJ1 314 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR51A2Q8NGJ7 313 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR4L1Q8NH43 312 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR4X1Q8NH49 305 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR52J3Q8NH60 311 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CXorf40AQ8TE69 158 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.6 ms