RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 UBALD1Q8TB05 177 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 C10orf90Q96M02 699 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 VPS25Q9BRG1 176 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 AUNIPQ9H7T9 357 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 ANXA10Q9UJ72 324 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRD-202ENST00000356435 PLA2G10O15496 165 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 EPPINO95925 133 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 RPS27P42677 84 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 TCTN1Q2MV58 587 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 Q7L0L9 218 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FGF11Q92914 225 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 NUMA1Q14980 2115 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 PRSS44E7EML9 344 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 HAX1O00165 279 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 PF4P02776 101 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ZXDAP98168 799 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SSX1Q16384 188 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ETV3LQ6ZN32 361 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 Q6ZN92 141 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SHISA5Q8N114 240 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ASB10Q8WXI3 467 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 NAA60Q9H7X0 242 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 RAC3P60763 192 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 RIGQ13278 110 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 MMDQ15546 238 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 TOMM20LQ6UXN7 152 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FAHD2AQ96GK7 314 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 KCNK15Q9H427 330 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 A0A1W2PS18 150 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 E9PQ18 207 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 H3BP45 60 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 DEDDO75618 318 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 GP1BAP07359 652 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 CCL2P13500 99 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF154Q13106 437 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 LHX8Q68G74 356 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FAM219AQ8IW50 185 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ZDHHC22Q8N966 263 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 OR6X1Q8NH79 312 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 C10orf35Q96D05 121 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 DPH3Q96FX2 82 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 OR2H1Q9GZK4 316 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 WASHC3Q9Y3C0 194 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 BTAF1O14981 1849 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 A0A1B0GTQ1 180 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SMPD2O60906 423 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 PEX11BO96011 259 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 P01737 135 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FAM87AP0C7U9 286 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ROM1Q03395 351 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 RASL12Q9NYN1 266 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 MYO9BQ13459 2157 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 MPTX1A8MV57 137 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 TRIM77I1YAP6 450 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 FAM106CPP0CH98 169 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 SPINK9Q5DT21 86 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 C12orf73Q69YU5 71 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 STXBP6Q8NFX7 210 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 COPS9Q8WXC6 57 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 OR10C1Q96KK4 312 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 STARD10Q9Y365 291 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 A0A1W2PQD3 144 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 TRDCB7Z8K6 153 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 PRDM14Q9GZV8 571 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 HIGD1AQ9Y241 93 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 GFRA3O60609 400 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 RHBDL1O75783 438 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 PF4V1P10720 104 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 C1orf53Q5VUE5 145 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 PET117Q6UWS5 81 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 THSD4Q6ZMP0 1018 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-202ENST00000356435 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms