RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PARP14Q460N5 1801 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MPC2O95563 127 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC6A1P30531 599 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM147Q9BVK8 224 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 BCL3P20749 454 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00596Q86U02 117 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MISP3Q96FF7 219 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF785A8K8V0 405 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR33A8MZF0 331 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LIMS1P48059 325 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GABRA6Q16445 453 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSM6Q6P461 480 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNK15Q9H427 330 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 S100A8P05109 93 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CD1AP06126 327 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1FQ16864 119 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 VSIG8P0DPA2 414 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FUT5Q11128 374 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX261Q6UWH6 196 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C1RLQ9NZP8 487 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 U3KQ87 197 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0U1RQV5 110 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM77I1YAP6 450 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 V9GYS6 101 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 VDAC1P21796 283 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMPRSS3P57727 454 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RHOFQ9HBH0 211 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4A8P0C604 315 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PMELP40967 661 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PPYP01298 95 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TTRP02766 147 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5I1Q13606 314 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PTX4Q96A99 478 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR137Q96N19 417 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SBF2Q86WG5 1849 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CPN1P15169 458 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MSL2Q9HCI7 577 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ICMTO60725 284 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GOSR1O95249 250 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QCP02747 245 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF883P0CG24 379 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR27Q6MZM9 219 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 DBX1A6NMT0 343 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 HNF1AP20823 631 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-DRB3P79483 266 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RTP5Q14D33 572 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM24AA6NFZ4 105 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV3-13P01766 116 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV3-7P01780 117 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 R3HDM4Q96D70 268 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SPSB2Q99619 263 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAM10O14672 748 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LTBRP36941 435 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PSG4Q00888 419 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CLLU1Q5K131 121 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms