RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 PRRX1P54821 245 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 COX19Q49B96 90 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 FZR1Q9UM11 496 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 LIPGQ9Y5X9 500 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 GGTLC2Q14390 218 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 TSPO2Q5TGU0 170 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 GPR87Q9BY21 358 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 SLC26A1Q9H2B4 701 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A9Q9NRM0 540 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 GAB4Q2WGN9 574 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf42Q8N5U0 333 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 SLC26A10Q8NG04 563 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T10Q8NGZ9 312 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 ONECUT1Q9UBC0 465 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 OOEPA6NGQ2 149 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 CA11O75493 328 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV20A0A0B4J274 112 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 BTNL3Q6UXE8 466 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 PAPPAQ13219 1627 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 MEOX2P50222 304 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 FAM78BQ5VT40 261 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF345Q14585 488 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 R3HDM4Q96D70 268 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 CHST5Q9GZS9 411 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 TCFL5Q9UL49 500 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 ACTL6AO96019 429 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 SP1P08047 785 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 PMS2P11Q13670 270 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 GAPTQ8N292 157 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 ANAPC16Q96DE5 110 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 CA10Q9NS85 328 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 EML2O95834 649 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 USF1P22415 310 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 OR2J3O76001 311 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 AMTP48728 403 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 OR2H1Q9GZK4 316 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf67F2Z3F1 127 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 J3QT63 122 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM3P40198 252 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 CT55Q8WUE5 264 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 CCL17Q92583 94 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 AMDHD2Q9Y303 409 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 GZMHP20718 246 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF154Q13106 437 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 OR1A1Q9P1Q5 309 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 VAX2Q9UIW0 290 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf80F5H4A9 247 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 DTD1Q8TEA8 209 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PRR13Q9NZ81 148 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SPINK4O60575 86 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SULT1A1P50225 295 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 HTR1DP28221 377 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS12P56730 875 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SPINK9Q5DT21 86 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SPINK14Q6IE38 97 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 OR4D10Q8NGI6 311 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PARP11Q9NR21 331 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF250P15622 560 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB34Q8NCN2 500 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS50Q9UI38 385 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 LAMB2P55268 1798 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SPINT1O43278 529 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SEC11BP0C7V7 166 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 HOGA1Q86XE5 327 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TUSC5Q8IXB3 177 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 OR5A2Q8NGI9 324 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 CCL28Q9NRJ3 127 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf210Q8IVY1 113 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 GPR35Q9HC97 309 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SIRT7Q9NRC8 400 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf77A4D0Y5 90 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 HAND1O96004 215 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PMELP40967 661 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 OR2M7Q8NG81 312 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 OR2M3Q8NG83 312 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 FOXS1O43638 330 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 IGF2P01344 180 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms