RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262291.8

VMP1-201, Transcript of vacuole membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMP1, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1-201ENST00000262291 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 IGHG3P01860 377 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 RPA2P15927 270 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 RAB5BP61020 215 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 IL13RA1P78552 427 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 ZNF124Q15973 351 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 LY6G6FQ5SQ64 297 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 OSR2Q8N2R0 312 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 CD300LBA8K4G0 201 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 S100A8P05109 93 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 GLRA1P23415 457 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 HOGA1Q86XE5 327 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 RPRMLQ8N4K4 120 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 ZADH2Q8N4Q0 377 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 TERB2Q8NHR7 220 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 FAM96BQ9Y3D0 163 aa11.66□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa11.65□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 SYNGR1O43759 233 aa11.65□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 CA6P23280 308 aa11.65□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 ZBTB25P24278 435 aa11.65□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 FOXC1Q12948 553 aa11.65□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.65□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 SLC25A42Q86VD7 318 aa11.65□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.65□□□□□ -0.54
VMP1-201ENST00000262291 C9orf170A2RU37 121 aa11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 OR5H14A6NHG9 310 aa11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 SELEP16581 610 aa11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 CLINT1Q14677 625 aa11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 RHOVQ96L33 236 aa11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 C5orf66Q9H5L9 145 aa11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 MBD2Q9UBB5 411 aa11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 ZNF391Q9UJN7 358 aa11.65□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 C5orf52A6NGY3 159 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 KNG1P01042 644 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 ZNF44P15621 663 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 LYG2Q86SG7 212 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 FZR1Q9UM11 496 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 SERPINE3A8MV23 424 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 CLN5O75503 358 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 CHATP28329 748 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 RTP5Q14D33 572 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 AADACL3Q5VUY0 350 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 TMEM230Q96A57 120 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 C14orf79Q96F83 325 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 LIME1Q9H400 295 aa11.64□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 RFPL4AA6NLU0 287 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 COLCA2A8K830 154 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 PGAM2P15259 253 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 NQO2P16083 231 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 PEA15Q15121 130 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 Q6ZPA2 131 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 ZNF442Q9H7R0 627 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 AQP7O14520 342 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 GPR37O15354 613 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 COX5BP10606 129 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 RBM11P57052 281 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 SSTP61278 116 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 FAM189A2Q15884 450 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 VAX1Q5SQQ9 334 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 IGF2-ASQ6U949 168 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 ZDHHC22Q8N966 263 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.63□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.62□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 F5H0A9 414 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 WRBO00258 174 aa11.62□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 RHBDL1O75783 438 aa11.62□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 FBP1P09467 338 aa11.62□□□□□ -0.55
VMP1-201ENST00000262291 GLI4P10075 376 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms