RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620505.1

TARDBP-222, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-222	ENST00000620505	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		7	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	MYDGF	Q969H8	173 aa		7	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	NRBF2	Q96F24	287 aa		7	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	SPACA5	Q96QH8	159 aa		7	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		7	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	CHST5	Q9GZS9	411 aa		7	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		7	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	GNG8	Q9UK08	70 aa		7	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		7	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		7	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505		K7EIL1	84 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	MGST3	O14880	152 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ENTPD6	O75354	484 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	CYB5A	P00167	134 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ALDOB	P05062	364 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ATF1	P18846	271 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	CDK2	P24941	298 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	GLIPR1	P48060	266 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	RBP2	P50120	134 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	MTCP1	P56278	107 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	P2RX3	P56373	397 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	AES	Q08117	197 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	UTF1	Q5T230	341 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505		Q8N3U1	123 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	FGGY	Q96C11	551 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	CIB1	Q99828	191 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505		H3BUI4	141 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	TOR1A	O14656	332 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	SH2D1B	O14796	132 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	OR2H2	O95918	312 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	IGKV1D-12	P01611	117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	IGHV3-7	P01780	117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	OR2T7	P0C7T2	308 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	OCM2	P0CE71	109 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF44	P15621	663 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF20	P17024	532 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	NFYB	P25208	207 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	HTR1F	P30939	366 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	BRS3	P32247	399 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	OR3A4P	P47883	348 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	KRTAP10-11	P60412	298 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF85	Q03923	595 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	IL18R1	Q13478	541 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ATP6AP1	Q15904	470 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505		Q8IYB0	196 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	EME1	Q96AY2	570 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF649	Q9BS31	505 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	NEK6	Q9HC98	313 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	HMG20A	Q9NP66	347 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	GLS2	Q9UI32	602 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	LEUTX	A8MZ59	168 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	HSPB6	O14558	160 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	SULT1C4	O75897	302 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	AMY1A	P04745	511 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	AMY2A	P04746	511 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC35A2	P78381	396 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	HNF4G	Q14541	408 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF146	Q15072	292 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	LTC4S	Q16873	150 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TARDBP-222	ENST00000620505	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		6.97	□□□□□ -1.29

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