RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF774Q6NX45 483 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF519Q8TB69 540 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 PIGTQ969N2 578 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 REG4Q9BYZ8 158 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHB10Q9UN67 800 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A23A1A5C7 686 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM212A6NML5 194 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC31A2O15432 143 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 HNF1AP20823 631 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 TAS2R60P59551 318 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 DNM1P46Q6ZS02 220 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 TMUB2Q71RG4 321 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF525Q8N782 197 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2AK2Q8NG84 335 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R14AQ96A00 147 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 INTS14Q96SY0 518 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXC2Q99958 501 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF416Q9BWM5 594 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 XKRY2A2RUG3 117 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 METTL21EPA6NDL7 271 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 MFSD2BA6NFX1 497 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 F5H5P2 479 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 TCAPO15273 167 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 RENP00797 406 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 CD3DP04234 171 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 CSF1P09603 554 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 CBR1P16152 277 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 S100A7P31151 101 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF84P51523 738 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 ADIPOQQ15848 244 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST3H3Q16695 136 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 C20orf204Q6ZNR8 217 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00346Q8IVM7 164 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF101Q8IZC7 436 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 NABP1Q96AH0 204 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 C4orf45Q96LM5 186 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 CHST6Q9GZX3 395 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 ELOVL3Q9HB03 270 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 TAS2R3Q9NYW6 316 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A13Q9Y226 551 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 WNK2Q9Y3S1 2297 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 A6NLC8 198 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM210A6NLX4 147 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 LPLP06858 475 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 ZP3P21754 424 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 CAMLGP49069 296 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXL14Q8N1E6 418 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF75AQ96N20 296 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 MLXQ9UH92 298 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 STARD10Q9Y365 291 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PPE2 198 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PR64 198 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS37A4D1T9 235 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 C5orf49A4QMS7 147 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF223E7ERA6 249 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 LGALS8O00214 317 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 FARS2O95363 451 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 TXNDC12O95881 172 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 CD99P14209 185 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 ALDH3B1P43353 468 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 GMFBP60983 142 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 EGR3Q06889 387 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 BTN1A1Q13410 526 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 MST1LQ2TV78 715 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC30A7Q8NEW0 376 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 THRSPQ92748 146 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM3DQ96BQ1 224 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 PPA2Q9H2U2 334 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGEF1-209ENST00000607882 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC100509620A0A075B734 347 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0U1RQK1 487 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF320A2RRD8 509 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 WRBO00258 174 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 NGFP01138 241 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV1-44P01699 117 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 DBHP09172 617 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 AKAIN1P0CW23 69 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS3P35030 304 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SERPINF1P36955 418 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 PSG4Q00888 419 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB35Q15286 201 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 C2orf76Q3KRA6 126 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 GSG1LQ6UXU4 331 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC16A13Q7RTY0 426 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 OTOSQ8NHW6 89 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SCARB1Q8WTV0 552 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 NINJ1Q92982 152 aa10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms