RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB127Q9H1M4 99 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNFSF15O95150 251 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADCYAP1P18509 176 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AADACP22760 399 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL12P30050 165 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ID4P47928 161 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NAAAQ02083 359 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TGIF1Q15583 401 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4A4PQ8NGN8 299 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF488Q96MN9 340 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF286AQ9HBT8 521 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C12orf4Q9NQ89 552 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM100Q9NV29 134 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MEMO1Q9Y316 297 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEP250Q9BV73 2442 aa10.15□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CACNA1GO43497 2377 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 K7EPK0 472 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFNA21P01568 189 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PET100P0DJ07 73 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NME2P22392 152 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM187Q14656 261 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GUCA2BQ16661 112 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MST1LQ2TV78 715 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIKESHIQ53FT3 197 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LHFPL5Q8TAF8 219 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APH1AQ96BI3 265 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR87Q9BY21 358 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NAA60Q9H7X0 242 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAF9BQ9HBM6 251 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRSS50Q9UI38 385 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM96BQ9Y3D0 163 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM218A2RU14 115 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM77I1YAP6 450 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 M0R296 226 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AGPAT2O15120 278 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBPP02686 304 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MEOX1P50221 254 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM33P57088 247 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR52M1Q8NGK5 317 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERGIC1Q969X5 290 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL36GQ9NZH8 169 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTCH1Q9NZJ7 389 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXL17Q9UF56 701 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GTF3C1Q12789 2109 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa10.14□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF732B4DXR9 585 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BET1O15155 118 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYNGR1O43759 233 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEDDO75618 318 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ECI1P42126 302 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSC22D1Q15714 1073 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL22RA1Q8N6P7 574 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EXTL1Q92935 676 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRRX2Q99811 253 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAJB11Q9UBS4 358 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PQLC2LA1A4F0 135 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCTP09683 121 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNFT1Q5M7Z0 435 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA46Q5T0L3 261 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HES3Q5TGS1 186 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM88Q6PEY1 159 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TP53RKQ96S44 253 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LPAR3Q9UBY5 353 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GLS2Q9UI32 602 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LHX6Q9UPM6 363 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMDHD2Q9Y303 409 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C21orf140B9A014 251 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01387J3KSC0 135 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SP1P08047 785 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LPAR6P43657 344 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STK11Q15831 433 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEK7Q8TDX7 302 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00470Q9BZP3 86 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABI3Q9P2A4 366 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TUBD1Q9UJT1 453 aa10.13□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa10.12□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PR80 420 aa10.12□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK2AP1O14519 115 aa10.12□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATG12O94817 140 aa10.12□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPYP01298 95 aa10.12□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL32P24001 234 aa10.12□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASCL1P50553 236 aa10.12□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC36Q8IYA8 594 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms