RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 OR5M11Q96RB7 305 aa6.41□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 TBX15Q96SF7 602 aa6.41□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CHST6Q9GZX3 395 aa6.41□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.41□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 METTL9Q9H1A3 318 aa6.41□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DUSP21Q9H596 190 aa6.41□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.41□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 HMG20AQ9NP66 347 aa6.41□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.41□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 A0A1W2PRD5 423 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 A0A1W2PRF3 423 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 A0A1W2PRM7 423 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 FUOMA2VDF0 154 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 K7N7A8 449 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DEGS1O15121 323 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 KDM4BO94953 1096 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CDRT1O95170 752 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 OR2H2O95918 312 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 FSHBP01225 129 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 IGKV1D-12P01611 117 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ALDOBP05062 364 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CD1AP06126 327 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 MMP9P14780 707 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PTGFRP43088 359 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 OR3A4PP47883 348 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 MTNR1BP49286 362 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 BPIFB3P59826 476 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ZP1P60852 638 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 GUCA2AQ02747 115 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DOC2BQ14184 412 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ZNF146Q15072 292 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 USP43Q70EL4 1123 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 OR8H2Q8N162 312 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PXT1Q8NFP0 134 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 TMEM203Q969S6 136 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 SLITRK2Q9H156 845 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 NOX4Q9NPH5 578 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ING3Q9NXR8 418 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.4□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 hADV38S2A0JD32 116 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 M0R1W7 72 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 HSPB6O14558 160 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MGST3O14880 152 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 GPX5O75715 221 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 VENTXO95231 258 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 PAHP00439 452 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 IGHV1-69P01742 117 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 FSTP19883 344 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 SERPINA2P20848 420 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MAP2K4P45985 399 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 HILS1P60008 231 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 ACTG1P63261 375 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 KLRD1Q13241 179 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 GPR50Q13585 617 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 GPR176Q14439 515 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 IRF3Q14653 427 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TRAM1Q15629 374 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 AWAT2Q6E213 333 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 ZNF529Q6P280 563 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 OSR2Q8N2R0 312 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 SVOPQ8N4V2 548 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 C3orf56Q8N813 242 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 CHST4Q8NCG5 386 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MUL1Q969V5 352 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 DUX5Q96PT3 197 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 DERL3Q96Q80 235 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MGLLQ99685 303 aa6.39□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 PPA2Q9H2U2 334 aa6.39□□□□□ -1.39
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