RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553732.1

TGFB3-AS1-201, TGFB3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TGFB3-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LGALS12Q96DT0 336 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SDSLQ96GA7 329 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RNF170Q96K19 258 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 COPS4Q9BT78 406 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCDC32Q9BV29 185 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CENPMQ9NSP4 180 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 U3KQV3 271 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.07□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TMEM210A6NLX4 147 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C17orf98A8MV24 154 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM25AB3EWG3 89 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM25CB3EWG5 89 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM25GB3EWG6 89 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PTGES3LE9PB15 166 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CDC42EP2O14613 210 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 XRCC2O43543 280 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCNKO75909 580 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 OR2F2O95006 317 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NDUFB2O95178 105 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RENP00797 406 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 AMY1AP04745 511 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 AMY2AP04746 511 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IFNA6P05013 189 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HCKP08631 526 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CD36P16671 472 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HTR1DP28221 377 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRDX2P32119 198 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IFNGR2P38484 337 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ETV6P41212 452 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 VBP1P61758 197 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NCS1P62166 190 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ACTA2P62736 377 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ACTG2P63267 376 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ACTC1P68032 377 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ACTA1P68133 377 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IFITM2Q01629 132 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KIR2DS1Q14954 304 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TRAM2Q15035 370 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TIGD4Q8IY51 512 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CD177Q8N6Q3 437 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 OR8U1Q8NH10 309 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PIGCQ92535 297 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 REEP6Q96HR9 211 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRRC1Q96M27 445 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FEVQ99581 238 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FUZQ9BT04 418 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 OPA3Q9H6K4 179 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DIABLOQ9NR28 239 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.06□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NOTOA8MTQ0 251 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 H3BSH0 61 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 M0QZK8 103 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 AIREO43918 545 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF728P0DKX0 622 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 OSMP13725 252 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRKACGP22612 351 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RCVRNP35243 200 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SOX6P35712 828 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MAP2K4P45985 399 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GSK3AP49840 483 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GNG2P59768 71 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRDX4Q13162 271 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SNAPC1Q16533 368 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.05□□□□□ -1.44
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms