RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519224.5

HSF4-208, Transcript of heat shock transcription factor 4, human

TSL 5

Gene HSF4, Length 637 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HSF4-208	ENST00000519224	MUL1	Q969V5	352 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HSF4-208	ENST00000519224	MGLL	Q99685	303 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HSF4-208	ENST00000519224	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HSF4-208	ENST00000519224		Q9H521	79 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HSF4-208	ENST00000519224	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HSF4-208	ENST00000519224	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HSF4-208	ENST00000519224	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HSF4-208	ENST00000519224	ESM1	Q9NQ30	184 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HSF4-208	ENST00000519224	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HSF4-208	ENST00000519224	KPTN	Q9Y664	436 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HSF4-208	ENST00000519224	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	SC5D	O75845	299 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	CPE	P16870	476 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	GABRR1	P24046	479 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	FPR2	P25090	351 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	OR3A1	P47881	315 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	MTNR1B	P49286	362 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	EDDM3B	P56851	147 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	GABARAPL2	P60520	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	GPR50	Q13585	617 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	RSU1	Q15404	277 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	GRK1	Q15835	563 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	SSX1	Q16384	188 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	PIGY	Q3MUY2	71 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	GPR157	Q5UAW9	335 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	TCF23	Q7RTU1	214 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	PHC2	Q8IXK0	858 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	OR8H2	Q8N162	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	TNFRSF14	Q92956	283 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	DUX5	Q96PT3	197 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	ING3	Q9NXR8	418 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224		A0A0G2JK05	382 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	SH2D1B	O14796	132 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	ZNF44	P15621	663 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	SERPINA2	P20848	420 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	LMO1	P25800	156 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	DLX6	P56179	175 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	ELP2	Q6IA86	826 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	SPART	Q8N0X7	666 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224		Q8NFD4	153 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	METTL9	Q9H1A3	318 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	PPA2	Q9H2U2	334 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	CKLF	Q9UBR5	152 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224		M0R1W7	72 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	DEGS1	O15121	323 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	HILS1	P60008	231 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	FABP5	Q01469	135 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	GFI1	Q99684	422 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	LRRC42	Q9Y546	428 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	ATR	Q13535	2644 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224		A0A0U1RQK1	487 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	HSPB6	O14558	160 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	MGST3	O14880	152 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	UCHL1	P09936	223 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	PRTN3	P24158	256 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	GLIPR1	P48060	266 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	AES	Q08117	197 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HSF4-208	ENST00000519224	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		11.17	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms