RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANXA3	P12429	323 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF250	P15622	560 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRKACA	P17612	351 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	HLA-G	P17693	338 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	BMP5	P22003	454 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZBTB25	P24278	435 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	FPR2	P25090	351 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	GCH1	P30793	250 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCKAR	P32238	428 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	GLRX	P35754	106 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR3A3	P47888	321 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	FABP6	P51161	128 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF83	P51522	516 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	DHODH	Q02127	395 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF154	Q13106	437 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	PDCD1	Q15116	288 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR8G1	Q15617	311 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGFBP7	Q16270	282 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	MSMP	Q1L6U9	139 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854		Q6P435	159 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854		Q6ZPA2	131 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854		Q6ZR03	302 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854		Q6ZS49	121 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	SSX8	Q7RTT4	187 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM17	Q86X19	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854		Q8IYB0	196 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	BATF2	Q8N1L9	274 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	POC1A	Q8NBT0	407 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	MUCL1	Q96DR8	90 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF488	Q96MN9	340 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR2A7	Q96R45	310 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPA2	Q9H2U2	334 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRORY	Q9H606	182 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	HES4	Q9HCC6	221 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	DLL4	Q9NR61	685 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	DECR2	Q9NUI1	292 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF69	Q9UC07	566 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF222	Q9UK12	451 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	DOCK7	Q96N67	2140 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854		A0A0B4J2A0	478 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	C9orf170	A2RU37	121 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR5H14	A6NHG9	310 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854		G3V3Q6	166 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	SMLR1	H3BR10	107 aa		3.8	□□□□□ -1.8

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