RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF708P17019 499 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUSP1P28562 367 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 S100A2P29034 98 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 FCGR2CP31995 323 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 CAMLGP49069 296 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SULT1A1P50225 295 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 NPY4RP50391 375 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPT1P50897 306 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGDIBP52566 201 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM33P57088 247 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAB4BP61018 213 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 TLE3Q04726 772 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 BAXQ07812 192 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 FZD2Q14332 565 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLINT1Q14677 625 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCNAB1Q14722 419 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 GNMTQ14749 295 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR8G1Q15617 311 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 GUK1Q16774 197 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 DEFB110Q30KQ9 67 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM209BQ5JX69 171 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 MARCH3Q86UD3 253 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 KMT5CQ86Y97 462 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 UEVLDQ8IX04 471 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR5AS1Q8N127 324 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 LGI3Q8N145 548 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 GATSQ8NAP1 163 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR13C9Q8NGT0 318 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR6X1Q8NH79 312 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPSB1Q96BD6 273 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 CMBLQ96DG6 245 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR10C1Q96KK4 312 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 TECTBQ96PL2 329 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 GAL3ST4Q96RP7 486 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLCC1Q96S66 551 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPER1Q99527 375 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHST5Q9GZS9 411 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 NAA60Q9H7X0 242 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM60AQ9NP50 221 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 NIT2Q9NQR4 276 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SERINC1Q9NRX5 453 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 C19orf12Q9NSK7 152 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 STARD5Q9NSY2 213 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR5AC2Q9NZP5 309 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 KIAA1456Q9P272 454 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 TINAGQ9UJW2 476 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PADI1Q9ULC6 663 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 RP1P56715 2156 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 F5P12259 2224 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 THADAQ6YHU6 1953 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A0A6YYD4 124 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A1B0GX78 115 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF726A6NNF4 738 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 B4DGG1 531 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SIGLEC5O15389 551 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ST8SIA3O43173 380 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.1 ms