RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 IGHV3-13P01766 116 aa14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF735P0CB33 412 aa14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 NAT1P18440 290 aa14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 VHLLQ6RSH7 139 aa14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 POM121Q96HA1 1249 aa14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 F5H5P2 479 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ABCD4O14678 606 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 HS3ST1O14792 307 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 PDCD6O75340 191 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 NDUFB6O95139 128 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.76□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 CBX5P45973 191 aa14.76□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 NUP37Q8NFH4 326 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ING3Q9NXR8 418 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 DUSP13Q9UII6 198 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 AK3Q9UIJ7 227 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 PDZD2O15018 2839 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.76□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 TBPP20226 339 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ERVK11-1P61568 191 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 CD300CQ08708 224 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 MAB21L1Q13394 359 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 MEF2DQ14814 521 aa14.76□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 SLC22A25Q6T423 547 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.76□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.76□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 C7orf66A4D0T2 115 aa14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 CDIPTO14735 213 aa14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 PEX14O75381 377 aa14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 PRKACAP17612 351 aa14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 HOGA1Q86XE5 327 aa14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 DYRK2Q92630 601 aa14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 MED30Q96HR3 178 aa14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 CCL19Q99731 98 aa14.75□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 SLC6A7Q99884 636 aa14.75□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 MED28Q9H204 178 aa14.75□□□□□ -0.05
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SRSF1-201ENST00000258962 DISC1C4P0D8 188 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 AMY2AP04746 511 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 PGA5P0DJD9 388 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FUT3P21217 361 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 HRH1P35367 487 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ZMYND11Q15326 602 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 MPV17LQ2QL34 196 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 SPERTQ8NA61 448 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 MBD6Q96DN6 1003 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 PLK3Q9H4B4 646 aa14.74□□□□□ -0.05
SRSF1-201ENST00000258962 RHOFQ9HBH0 211 aa14.74□□□□□ -0.05
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